HLA等位基因序列特异性探针(SSO)及其标记
HLA 等位基因序列特异性探针(SSO)及其标记 (一)DRB1分型SSO探针 根据分辨率的要求选择。 常用的DRB1分型的SSO探针见表
代号 | SSO探针的DNA序列(5’-3’) | DR特异性 |
L11 | TTCAAACTTAAGCTGCCAC | DR1 |
D11 | CTCATACTTATCCTGCTGC | DR2 |
N77 | TCTGCAGTAGTTGTCCACC | DR3 |
H33 | CTCTTGGTGATAGAAGTATC | DR4 |
E58 | CCAGTACTCCTCATCAGGC | DR11 |
L37 | AGCGCAGGAGCTCCTCCTG | DR12 |
G11 | CTTATACTTACCCTGCCAC | DR7 |
L74 | GTGTCCACCAGGGCCCGCC | DR8(+1403) |
Y26 | CTGTGCAGATACCGCACCC | DR9 |
V11 | CTCAAACTTAACCTCCTCC | DR10 |
E71 | GGCCCGCTCGTCTTCCAGG | DR13(1301,1302,1304) |
DR1(0103) | ||
DR4(0402,0414) | ||
DR11(1102,1103) | ||
K71 | CGGCCCGCTTGTCTTCCAG | DR13-HAG(1303) |
H60 | GTTCCAGTGCTCCGCAGCA | DR14(1401,1404,1407) |
N37 | AGCGCACGTTCTCCTCCTG | DR3 |
DR13(1301,02,04,06) | ||
DR14(1402,1403,1406) | ||
D37 | GAAGCGCAAGTCCTCCTCT | DR2(DRB5*0101) |
AV86 | GCTCTCCACAGCCCCGTAG | DR2(DRB5*02) |
DR1(0102) | ||
DR12 |
(二)SSO探针标记 SSO探针标记可以采用放射性同位素标记,也可采用非同位素表记。下面介绍的是采用T4噬菌体多核苷酸激酶将放射性同位素γ-32 P标记在SSO探针上。 【试剂配制】 (1) SSO探针(10pmol/L) (2) 10XT4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液:0.5mol/LTris-HCl(pH7.6);0.1mmol/L MgCl2;50mmol/L二巯苏糖醇(DTT);1mmol/L盐酸亚精胺;1mmol/L EDTA(pH8.0) (3)[γ-32 P]ATP(比活5000Ci/mmol,10mCi/ml水溶液) (4)T4噬菌体多核苷酸激酶 【操作步骤】 (1)配制标记反应混合液 SSO探针(10pmol/L) 1.0ul 10XT4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液 2.0ul [γ-32 P]ATP 5.0ul ddH2 O 11.4ul (3) 在上述反应混合液中加入8单位(约1ul)T4噬菌体多核苷酸激酶,充分混匀,置37℃温育45分钟; (4) 温育完毕后,置68℃10分钟,灭活T4噬菌体多核苷酸激酶。 【注意事项】 (1) 标记后的SSO探针比活应达到2000Ci/mmol,如果比活性太低,可在标记反应中补加8单位T4噬菌体多核苷酸激酶继续标记。 (2) 上述标记的SSO探针可直接使用,也可以采用柱层析分离后使用。 (3) 放射性物质的操作应严格遵守有关规定和采取适当的防护措施。