酵母双杂详细操作步骤
一、构建重组Activation Domain(AD)融合的重组质粒(pGADT7载体)以及Binding Domain(BD)融合的重组质粒(pGBKT7载体);
二、双向酵母双杂交实验鉴定蛋白质间的相互作用
1、酵母转化中DNA混合液的配制
在制备酵母感受态的过程中配制下面的DNA转化混合液(1×):
2、酵母感受态细胞的制备以及共转化,下面是所需用量为10个转化实验的酵母感受态细胞的制备。
(1)挑取平板上AH109酵母细胞的单个克隆至5 mL YPD培养基中,30℃,摇床振摇培养过夜(可加入2 mg/mL的Adenine 75μL使酵母生长速度加快);
(2)转接2.5 mL过夜培养的菌液至50 mL YPD培养基中继续培养约3-4 h(OD600~2-4);
(3)用50 mL的离心管收菌,4,500 rpm,3 min,弃上清;
(4)加入20 mL无菌水洗涤,同样条件离心,弃上清;
(5)用1 mL无菌水重悬菌液,转移至1.5 mL的EP管中;
(6)最高速短时离心15 Sec;弃上清;
(7)加入450μL LiAc(0.1 M)重悬菌体,30℃摇床振摇培养15 min;
(8)分装50μL/管至EP管中;
(9)最高速短时离心15 Sec;弃上清;
(10)每管加入已经配制好的DNA转化混合液(可加入40μL DMSO以提高转化效率),彻底重悬细胞,30℃摇床振摇培养45 min;
(11)转移至42℃水浴20 min;
(12)冰上放置3 min;
(13)最高速短时离心30 Sec;弃上清;
(14)加入100μL无菌水重悬菌体,涂布于SCM/-2(缺少色氨酸和亮氨酸的酵母合成培养基)氨基酸缺陷型平板上。30℃恒温箱倒置培养3天后观察菌落生长情况。
3、酵母双杂系统相互作用的筛选
(1)3天后,在转化后的平板上各挑取四个单菌落,分别划线于SCM/-2、SCM/-3(缺少色氨酸、亮氨酸和组氨酸的酵母合成培养基)和SCM/-4(缺少色氨酸、亮氨酸、组氨酸和腺嘌呤的酵母合成培养基)氨基酸缺陷型平板上,30℃恒温箱倒置培养3天后观察菌落生长情况。
(2)如果菌落能在SCM/-4平板上正常生长,说明AD-fusion和BD-fusion两者之间有强的相互作用;如果不能在SCM-4平板上正常生长但是能在SCM/-3平板上正常生长,则有弱的相互作用;如果在SCM/-4和SCM/-3平板上均不能生长而只能在SCM/-2平板上生长,则无相互作用。