DNA分离前你应该知道的那些事
DNA 是相当稳定的。这也是保存和传递遗传信息所必须具备的但是不能因此而太随意,DNA的污染来源主要是其他DNA 。
DNA 分离
分离的DNA可以是基因组的也可以是染色体组外的。
研究DNA 分离试剂盒,这些试剂盒可以是针对基因组的和染色体组外的DNA、从琼脂糖凝胶中分离DNA或者从PCR产物中抽提DNA。他们利用一些结合DNA的树脂或者滤膜,通常是一些小的离心柱,可以避免酚抽提和CsCI 超离心。
染色体组外的DNA作为噬菌体或质粒DNA抽提出来。
大片断的DNA, 比如说基因组DNA必须小心操作,以防止断裂,其抽提和储存不同于小片断DNA 。
DNA 制备可分为小量、中量和大量制备, 小量制备就可以满足大多数的使用要求。
DNA的质量鉴定是需要的。有些过程比如DNA测序或者转染哺乳动物细胞需要高质量的DNA , 而其他操作如限制性图谱筛选克隆,对DNA 的质量要求不十分严格。
测定的单位
1 kb DNA = 6. 5 x 105 Da 的双链DNA (钠盐)
1 kb DNA = 3.3 x 105Da 的单链DNA (钠盐)
1 kb DNA = 3.4 x 105Da 的单链RNA (钠盐)
1 kb DNA = 37000Da = 333 个编码氨基酸
1 个脱氧核糖核昔酸碱基的平均分子量= 324.5 Da
1 个脱氧核糖核昔酸碱基对的平均分子量·= 649 Da
1 μg/ml 的1 kb DNA = 3.08 nmol/L 5‘端
1 μg/ml 的DNA= 3. 08 μmol/L 磷酸盐
表 1 基因组DNA
物种 | 碱基对/单倍体基因组 | 单拷贝基因的拷贝数量 |
大肠杆菌 | 4.7X 106bp | 1.8X108 |
果蝇 | 1.4X 108bp | 6.6 X 105 |
小鼠 | 2.7X 109bp | 3.4 X 105 |
人 | 3.3X 109bp | 2.8 X 105 |