酵母单杂交实验详细步骤
一、构建诱饵菌株
1、制备YM4271感受态细胞
2、取上述感受态菌液,与1μg pHisi-cor promoter质粒混匀后加入预冷为0.2cm(electrode gap)电击转化杯(cuvette)中,置于冰上3min;
3、设置BTX电转仪的参数进行电转化(高压脉冲1.8kV)5ms;
4、吸出菌液后涂布至SD/Ura-平板,正置1小时,然后28℃倒置培养2-5天,待其长出明显的单菌落。
5、从平板上挑取单克隆落接种到2mL的液体SD/Ura-中,30℃振荡培养过夜OD600达0.6-1.0。
二、自激活验证
1、以上步扩大培养的菌株,进行感受态细胞制备
2、取该感受态菌液,与1μg pGADT7 AD质粒混匀后加入预冷为0.2cm(electrode gap)电击转化杯(cuvette)中,置于冰上3min;
3、设置BTX电转仪的参数进行电转化(高压脉冲1.8kV)5ms;
4、吸出菌液后涂布至SD/Ura-Leu-平板,正置1小时,然后28℃倒置培养2-5天,待其长出明显的单菌落。
5、从平板上挑取单克隆落接种到2mL的液体SD/Ura-Leu-中,30℃振荡培养过夜OD600达0.6-1.0。
6、配制含有不同浓度3-AT的SD/Ura-Leu-平板,浓度设置为10,15,20,50ug/ml。
7、按照五个稀释梯度,每滴2ul进行酵母点菌实验,28℃倒置培养3天,发现以上4个3-AT浓度梯度下,均无菌落生长,选择5ug/ml 3-AT作为后续互作验证筛选浓度。
三、转化诱饵菌株
1、以步骤1中扩大培养的cor promoter诱饵菌株,进行感受态细胞制备
2、取该感受态菌液,与1μg pGADT7-bHLH3质粒混匀后加入预冷为0.2cm(electrode gap)电击转化杯(cuvette)中,置于冰上3min;
3、设置BTX电转仪的参数进行电转化(高压脉冲1.8kV)5ms;
4、吸出菌液后涂布至SD/Ura-Leu-平板,正置1小时,然后28℃倒置培养2-5天,待其长出明显的单菌落。
5、从平板上挑取单克隆落接种到2mL的液体SD/Ura-Leu-中,30℃振荡培养过夜OD600达0.6-1.0。
相同方法转化cor promoter mutant诱饵菌株和jaz3 promoter诱饵菌株。
四、阳性对照酵母YM4271/pGADT7-P53/SV40复苏
1、取冻存的酵母YM4271/pGADT7-P53/SV40细胞,用接菌环在融化的菌液表面蘸一下,在SD/-Leu固体平板上划线,30℃倒置培养2天;
2、从平板上挑取单克隆落接种到液体SD/-Leu中,30℃振荡培养过夜至OD600达0.8
五、阴性对照酵母YM4271/pGADT7-lam/SV40复苏
1、取冻存的酵母YM4271/pGADT7-lam/SV40细胞,用接菌环在融化的菌液表面蘸一下,在SD/-Leu固体平板上划线,30℃倒置培养2天;
2、从平板上挑取单克隆落接种到液体SD/-Leu中,30℃振荡培养过夜至OD600达0.8
六、点菌
1、分别配制含有5ug/ml 3-AT的SD/-Leu/-his/-Trp平板和SD/-Leu/-Trp平板。
2、将步骤3~5中扩大培养的菌株,按照五个稀释梯度,每滴2ul进行酵母点菌实验,28℃倒置培养7天,进行扫描观察。