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通过CsCl 等密度梯度离心纯化λ噬菌体颗粒实验

2024-05-21 DNA 加入收藏
原理CsCl 等密度梯度离心用于制备最高纯度的感染性 λ 噬菌体颗粒,它没有任何细菌核酸的污染。从这种噬菌体颗粒中提取的 DNA 可用作 DNA 测序的模板、亚


原理

CsCl 等密度梯度离心用于制备最高纯度的感染性 λ 噬菌体颗粒,它没有任何细菌核酸的污染。从这种噬菌体颗粒中提取的 DNA 可用作 DNA 测序的模板、亚克隆至质粒载体和产生用于原位杂交的探针。这种方法第二个优点是,由它所获得的噬菌体原种是高度浓缩的(大于 1011 cfu/ml),在 4℃ 保存时,许多年后仍能保持它们的感染力。

材料与仪器

λ 噬菌体悬浮液
CsCl 乙醇
Beckman SW41 或 SW28 转子或相当型号 Beckman Ti50 或 SW50.1 转子或相当型号 皮下注射用针头

步骤

一、材料

1. 缓冲液和溶液

(1) CsCl(固体)

(2) CsCl 溶液



(3) 乙醇

2. 离心机和转子

(1) Beckman SW41 或 SW28 转子或相当型号

(2) Beckman Ti50 或 SW50.1 转子或相当型号,配有清亮的离心管(如 Beckman 超亮离心管)

3. 专用设备

皮下注射用针头(21号)

4. 载体和菌株

λ 噬菌体悬浮液

二、方法

1. 测定噬菌体悬浮液的体积,每毫升加入 0.5 g 固体 CsCl,搅拌混匀使其完全溶解。

2. 倒入足够量的 CsCl 分级梯度,使噬菌体悬浮液分成几个组分,每个梯度能容纳约 16 ml 噬菌体悬浮液。所需分级梯度的量等于亲水相的最终体积(步骤1),亲水相又被分成数份,每份为 0.4 X 离心管体积。用适合于 Beckman SW41 或 SW28 转子(或相当型号)的清亮塑料离心管(如 Beckman 超亮离心管)。



3. 在 ρ=1.50 g/ml 和 ρ=1.45 g/ml 两层界面的相应试管壁外侧,用永久性标签笔作上标记。



CsCl 分级梯度大约占超离管体积的 60%。比如,对一个能装 38 ml 的 Beckman SW28 试管(或相当型号),分级梯度由三种均为 7.6 ml 的 CsCl 溶液组成。平衡管装有同样密度的 CsCl 溶液。

4. 小心地将噬菌体悬浮液加至分级梯度上,4℃,87000 g ( 22000 r/min 于 Beckman SW28 转子中)离心 2 h。

5. 按下面的方法对离心管进行穿孔,以收集噬菌体颗粒。

(1) 用酒精仔细地擦去离心管外的油污,然后在离心管的外侧贴上 Scotch 胶带,与噬菌体颗粒带平齐。

胶带起到封条的作用,防止针头四周渗漏。

(2) 用 21 号皮下注射用针头(不需要注射针筒)穿过胶带刺入离心管,收集噬菌体颗粒带。



手指远离针头刺入方向,以免剌穿离心管。注意不要使梯度中其他带内物质污染噬菌体颗粒。这些带内含有细胞碎片和未装配的噬菌体成分。

6. 将噬菌体颗粒悬浮液装入适宜于 Beckman Ti50 或 SW50.1 转子(或相当型号)的超离管中,加入 CsCl 溶液(ρ=1.5 g/ml 于 SM 中)。4℃,150000 g ( 41000 r/min 于 Beckman Ti50 转子中)离心 24 h 或 160000 g ( 36000 r/min 于 Beckman SW50.1 转 子中)离心 24 h。



7. 如步骤 5 所述收集噬菌体颗粒带,于 CsCl 溶液中 4℃ 密封保存于一试管中。

8. ( 可供选择)如果必要,噬菌体颗粒可通过新一轮的 CsCl 平衡梯度离心进一步纯化和浓缩。将噬菌体悬浮液转移至适宜于 Beckman SW50.1 转子(或相当型号)的一个或多个超离管中,加入 CsCl 溶液(ρ=1.5 g/ml 于 SM 中),160000 g ( 36000 r/min 于 Becrkman SW50.1 转子中)4℃ 离心 24 h。当离心完成后,如下面“替代方案”的步骤 3 和 4 所述收集噬菌体颗粒。




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