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PCR

RT-PCR PROTOCOL

2024-11-12 PCR 加入收藏
RT-PCR PROTOCOL材料与方法…………………………………………………………1 .材料 ………………………………………………………1.1 供试用组织

RT-PCR PROTOCOL

材料与方法…………………………………………………………

1 .材料 ………………………………………………………

1.1   供试用组织( 细胞)…………………………………

1.2   主要仪器设备………………………………………

1.3   主要试剂……………………………………………

1.4   工具酶及试剂盒……………………………………

2. 实验方法……………………………………………………

2.1        总RNA 提取 …………………………………………

2.2  RT-PCR………………………………………………

2.3        琼脂糖凝胶电泳……………………………………

材料与方法

1.       材料

1.1       供试用动物组织/ 细胞

1.2       主要仪器设备

1.5ml 离心管、0.2ml PCR 管、高速离心机、5~10ul 加样器、2~20ul  加样器、20~200ul 加样器、TAKARA   PCR 仪、551 可见光透射仪

1.3       主要试剂

RNAlocker 、RNAout 、RNAsaver 、氯仿、异丙醇、75% 乙醇、琼脂糖、SYBRGREEN I 染料。

1.4       工具酶及试剂盒

TaKaRa One Step RNA PCR Kit

2.       方法

2.1       RNA 提取和纯化

估算RNAout 、组织或细胞的用量。取组织或细胞后,将剩余的组织或细胞放入RNAlocker 中保存以备下次使用。将组织或细胞匀浆后,加入1.5ml 离心管。加入0.2 倍RNAOUT 体积的氯仿,振荡混匀30 秒。室温离心15000g 3 分钟。将上清液转移到另一干净离心管中。在上清液中加入等体积的异丙醇, 振荡器上振荡混均30 秒。室温离心15000g 5 分钟,RNA 沉淀将在离心底的侧面形成,小心吸弃上清液。清洗:在含RNA 沉淀的离心管中加入1 毫升75% 乙醇, 振荡器上振荡混均30 秒。室温离心15000g,1 分钟。小心吸弃上清液。重复清洗步骤。将离心管倒置于滤纸上以干燥RNA 。加DEPC 水使RNA 沉淀溶解,剩余的RNA 沉淀使用RNAsaver 溶解以备下次使用。

2.2       RT-PCR

2.2.1        取  TaKaRa One Step RNA PCR Kit ,按下列组成配制  RT-PCR  反应液。

10 ×One Step RNA PCR Buffer                    5 μl

MgCl2 (25mM)                                10 μl

dNTP Mixture(10mM)                         5 μl

Rnase Inhibitor(40U/ μl)                   1 μl

AMV RTase XL(5U/ μl)                       1 μl

AMV-Optimized Taq  (5U/ul)                   1μl

上游特异性引物(20μM )                        1μl

下游特异性引物(20μM )                        1μl

Positive Control RNA 或实验样品(≤1μg total RNA )*             1μl

Rnase Free dH2 O                            24μl

Total                           50μl/Sample

*  当目的RNA 的表达数量较少时,可加至25 μl 。同时在反应体系中相应地应叫少Rnase Free dH2 O 的量。

2.2.2        按以下条件进行  RT-PCR  反应。

50  ℃30min         RT  反应

94  ℃2min          RTase  失活

94  ℃30sec

37  ℃~65℃30sec

72  ℃1~10min       PCR  反应25~30 循环

●        当  RNA  为  Positive Control RNA  时,反应条件如下。

50  ℃15min          RT  反应

94  ℃2min           RTase  失活

94  ℃30sec

60  ℃30sec

72  ℃1.5min           25~30  循环

2.2.3反应结束后,取  PCR  反应液   (5 ~ 10     l)   进行琼脂糖凝胶电泳,确认  RT-PCR  反应产物。

如果此  PCR  产物需用于以后实验,应将  PCR  产物冷冻保存。

Control  反应时扩增片段大小为  462 bp  。

2.3       RT-PCR 产物确认

电泳后,将SYBRGREEN I 染色的凝胶用可见光透射仪观察结果,确认RT-PCR 产物。


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