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PCR

PCR技术(PCR ,Polymerase chain reaction)

2024-11-16 PCR 加入收藏
PCR (Polymerase chain reaction) 是用一对寡聚DNA作为引物,通过加温变性-退火-DNA合成这一周期的多次循环,使目的DNA片段得

PCR (Polymerase chain reaction) 是用一对寡聚DNA作为引物,通过加温变性-退火-DNA合成这一周期的多次循环,使目的DNA片段得到扩增。由于这种扩增产物是以指数形式积累的,经25-30个循环后,扩增倍数可达106。Dr. Karry Mullis 1985年发明,获1993年度诺贝尔化学奖;

(一)基本要素

1、Taq DNA聚合酶:

水生栖热菌(thermus aquaticus,Taq)的DNA聚合酶

①5’→3’DNA聚合酶活性;  ②无3’→5’外切酶活性,  35轮0.25%错配,与原始模板有差别;  最适聚合酶 温度72℃,选择72℃延伸  半衰期:92.5℃ 130mi        95℃ 40min    97.5℃5—6min  变性温度:≤95℃使其在整个扩增循环中保持足够活性

pfu DNA 聚合酶

耐热  5’→3’DNA聚合酶活性  3’→5’外切酶活性   精确度:pfu >Taq  但pfu扩增效率通常比Taq酶略         文献报道:Taq+pfu 会起到较好效果

2、Primer 本身不要出现内部互补序列形成loop环,内部二级结构如: GGGTCGATTCCTACCCATGC 

注意减少Primer间互补序列导致2个Primer形成dimer一般不要超过3个互补bp  

Primer 5’未端可修饰、突变:修饰,如:32P、生物素、荧光素,不影响其效果;突变:AGCTCCATGACCCAG  5’CGCTCCATGACCCAG   3‘

注意:绝不可以在3’端进行上述改造 

∵DNA聚合酶是5’→3’聚合,若3’端改造→不能互补→不能延伸

primer  5’端增加碱基  ATG起始密码    TAA、TAG、TGA终止密码     如:可溶性受体的表达,无膜内区、穿膜区,只有膜外区。

3、模板:

可选:DNA    mRNA→逆转录→cDNA    DNA包括:  质粒      噬菌体      染色体DNA    较小       较大       ①目的gene是单拷贝    变性较易   变性较难   ②非常大,变性难    模板用量    Plasmid:lng    Chromosome:300-500ng    注意:  防止交叉污染 


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