Southern 印迹实验(电转印法)
原理因为聚丙烯酰胺凝胶的扎径太小,DNA不能在其横截面上有效地扩散,毛细管转移法不适用DNA从聚丙烯酰胺凝胶的转移。因此,聚丙烯酰胺凝晈必须在低离子强度的缓冲液
原理
因为聚丙烯酰胺凝胶的扎径太小,DNA不能在其横截面上有效地扩散,毛细管转移法不适用DNA从聚丙烯酰胺凝胶的转移。因此,聚丙烯酰胺凝晈必须在低离子强度的缓冲液中用电转移法进行印迹。
材料与仪器
DNA
TBE
Scotch-Brite垫 Whatman滤纸
TBE
Scotch-Brite垫 Whatman滤纸
步骤
1. 在非变性或变性聚丙烯酰胺凝胶中电泳DNA样品。
2. 电泳将近结束时,将一张大小足以覆盖凝胶中相应部分的尼龙膜漂浮于蒸馏水表面,然后浸入水中泡5 min。
3. 从电泳装置中取去一块玻璃板,染色后对凝胶进行照相(如果是非变性胶)在凝胶的表面铺一张Whatman 3 MM 滤纸,排去其间的所有气泡。
4. 揭起滤纸将凝胶剥离玻璃板。
4. 揭起滤纸将凝胶剥离玻璃板。
5. 将2块Scotch-Brite垫浸泡于0.5XTBE电泳缓冲液中,反复挤压和振动除去气泡。
6. 裁7张与凝胶大小相等的Whatman 3 MM 滤纸,浸于0. 5×TBE电泳缓冲液中15~30 min。
6. 裁7张与凝胶大小相等的Whatman 3 MM 滤纸,浸于0. 5×TBE电泳缓冲液中15~30 min。
7. 将一块饱和过的Scotch-Brite垫置于凝胶容器中灰色嵌板的内表面,将3张浸湿的滤纸置于其上,一次放一张,排去其间的气泡。
8. 将贴着凝胶的滤纸用0.5×TBE浸没,置于上述滤纸层之上4将凝胶的表面用0.5xTBE浸没,将预先浸湿的膜置于凝胶之上。
9. 用0.5xTBE浸没膜的表面,将剩余旳4张饱和过的Whatman 3 MM 滤纸置于其上。
10. 再加上另一块饱和过的Scotch-Brite垫,关上凝胶容器。
10. 再加上另一块饱和过的Scotch-Brite垫,关上凝胶容器。
11. 用0.5xTBE半充满下Tras-Blot电转印室,将凝胶容器置于其中,使灰色嵌板面向阳极。
12. 加入0.5xTBE充满转印室,打开冷却装置,在30 V 下进行电转印。
12. 加入0.5xTBE充满转印室,打开冷却装置,在30 V 下进行电转印。
13. 取下膜,用铅笔作好标记或切去一角标示膜的方向。
14. 从非变性凝胶转印的膜要进行变性,DNA面朝上,凝胶在3张用0.4 mol/l NaOH 浸泡过的Whatman 3 MM 滤纸之上放置10min。
15. 用2xSSC漂洗膜,置于一张Whatman 3 MM 滤纸上晾干,固定其DNA。将膜保存于室温。
14. 从非变性凝胶转印的膜要进行变性,DNA面朝上,凝胶在3张用0.4 mol/l NaOH 浸泡过的Whatman 3 MM 滤纸之上放置10min。
15. 用2xSSC漂洗膜,置于一张Whatman 3 MM 滤纸上晾干,固定其DNA。将膜保存于室温。