植物组织样本DNA提取步骤
一、植物组织DNA提取仪器与设计准备
实验仪器:高速离心机;烘箱;冰箱;水浴锅;高压灭菌锅;Nanodrop。
实验试剂:玻璃珠,十二烷基磺酸钠(SDS);三羟甲基氨基甲烷(Tris);乙二胺四乙酸(EDTA);氯化钠;苯酚;氯仿;无水乙醇等。
二、植物组织DNA提取步骤
植物组织的DNA提取通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用。详细操作步骤如下:
1、SDS提取缓冲液在65℃水浴中预热。
2、将叶片置于1.5ml离心管中,液氮速冻,组织研磨器打样。
3、加入700 ml的SDS提取缓冲液,涡旋摇匀。
4、置于65℃的水浴中,每隔10 min轻轻摇动,30 min后取出。5.加入200 ml KAc溶液,摇匀,放入-20℃冰箱30 min。
5、10000 rpm离心5 min,上清移至新离心管中,12000 rpm离心5 min。
6、上清移至新离心管中,加入700 ml异丙醇,-20℃冰箱30 min。
7、10000 rpm离心5 min,弃上清,加入500 ml 70%乙醇漂洗。
8、弃液体,晾干。
9、DNA纯度与浓度测定(使用nanodrop)。
DNA纯度:DNA的OD260/OD280一般为1.8左右。
OD260/OD280»1.8:说明较纯;
OD260/OD280>1.8:说明可能有RNA污染;
OD260/OD280<1.8:说明可能有蛋白质污染。
三、植物组织DNA提取注意
1.叶片磨得越细越好。
2.注意移液器的正确使用。
3.由于植物细胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中加入EDTA抑制酶的活性外,第一步的操作应迅速,以免组织解冻,导致细胞裂解,释放出DNA酶,使DNA降解。