GST pulldown实验操作步骤
一、GST-a融合蛋白的制备
1、GST-a融合蛋白的表达
(1)将目的蛋白与GST的重组质粒转化到BL21菌株中;
(2)挑取单克隆到含有5mL LB培养基(加入5μL氨苄)的10 mL试管里,37℃恒温振荡培养箱中培养过夜;
(3)将培养菌液转移到含有500mL LB(含500μL氨苄)的1L锥形瓶中,37℃,200 rpm培养数小时;
(4)测定OD600值,当OD600达到0.6左右时,加入适当浓度的IPTG,在20℃,200rpm条件下培养10-16h(通常需要进行预实验以确定最佳IPTG浓度、诱导温度和时间);
(5)诱导适当时间后,将菌液分次倒入50 mL离心管中,4℃4000 rpm离心10分钟,然后弃去上清,收集管底菌体,如暂时不用,可将菌体保存于-80℃冰箱中;
(6)先加入少量PBS于离心管中,离心5-10 min后弃去上清,再按每10 mL菌液沉淀1 mL PBS的量加入相应的PBS,涡旋振荡,使菌体沉淀充分溶解于PBS溶液中;
(7)把混合菌体置于冰水浴中,用超声仪进行破碎。每次超声破碎20 s,间隔30 s(破碎时间、破碎次数和间隔时间视具体情况而定),经过适当时间超声后,溶液会显得澄清;
(8)将超声后的溶液4℃4000 rpm离心10分钟,上清液转移至新的离心管中,-80℃保存备用。
2、GST-a融合蛋白的纯化
(1)在新鲜制备的裂解液上清中加入适量体积50%Glutathione Sepharose 4B,4℃摇床上缓慢摇动30~60 min;
(2)4℃,4000rpm离心5 min,弃去上清,该Sepharose上结合了GST-a融合蛋白;
(3)加入200μL预冷的PBS溶液,轻晃悬浮珠子,将Sepharose洗涤一次,4℃,4000 rpm离心5 min,弃去上清,重复此步骤3次;
(4)最后一次用移液枪吸走珠子表面的液体,但注意不要吸走珠子,即可获得结合GST-a的Sepharose。
二、体外蛋白的结合
1、将结合有GST-a融合蛋白的Sepharose 4B悬浮在适量体积的缓冲液中,加入20μL含有b蛋白的溶液,同时采用结合有GST蛋白的Sepharose作为阴性对照,在摇床上晃动4-8h(4℃);
2、4℃,4000 rpm离心5 min,弃去上清液;
3、沿壁加入200μL预冷的缓冲液对Sepharose进行洗涤,
4、4℃,4000rpm离心5 min,弃上清,该步骤重复3次;
5、吸干Sepharose上面的液体后,加入20ul 1×蛋白电泳上样缓冲液,沸水浴5 min,放入-20℃冰箱备用;
6、通过SDS-PAGE和Western blot进行检测。