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PCR

原位聚合酶链式反应(in situ PCR)和原位反转录

2024-11-18 PCR 加入收藏
(一)、仪器设备 英国 Thermo Hybaid 原位 PCR 仪。 (二)、操作流程 1 、原位 PCR 步骤 1 )预处理

(一)、仪器设备    英国 Thermo Hybaid 原位 PCR 仪。    (二)、操作流程      1 、原位 PCR 步骤      1 )预处理:      ( 1 )切片常规脱蜡;      ( 2 ) 0.2mol/L HCl 处理 10min ;      ( 3 ) 5 μ g/ml 蛋白 酶 K 消化组织 37 ℃ 10min ;     ( 4 ) Nase 消化组织 37 ℃ 30min ;      ( 5 )梯度酒精脱水,室温干燥。      2 )原位扩增:      ( 1 )切片滴加特异性序列引物 30 μ LPCR 扩增反应液,覆盖硅化盖玻片,石蜡油封边;      ( 2 ) PCR 热循环: 94 ℃, 1min ; 55 ℃, 1min ; 72 ℃, 1.5min ,共 25 ~ 30 个循环, 72 ℃延伸 10min ;      ( 3 )氯仿洗去盖玻片, 4 %多聚甲醛后固定 10min ,梯度酒精脱水,干燥。      3) 原位杂交:      ( 1 )加地高辛标记探针的杂交液, 98 ℃变性 10min , -20 ℃退火 5min , 42 ℃杂交过夜。      ( 2 )杂交后用 2×SSC 洗涤 10min , 3 次, 1×SSC 洗涤 10min , 3 次;      ( 3 )缓冲液洗涤 10min , 3 次;      ( 4 )加碱性磷酸酶标记的羊抗地高辛抗体复合物, 37 ℃, 2h ;      ( 5 )缓冲液洗涤 5min , 3 次;      ( 6 ) NBT 、 BCIP 暗处显色,镜下控制,终止显色。     ( 7 )常规脱水:透明、封固。     2 、原位 RT-PCR 步骤    1 )预处理:      ( 1 )蛋白 酶 K(0.3mg/mL) 54 ℃消化 20min ,蒸馏水洗;      ( 2 ) 95 ℃加热 3min ,灭活残存的蛋白 酶。      2 )原位扩增:      ( 1 )在有 RNA 酶抑制剂存在的条件下,用随机六聚物进行逆转录反应;      ( 2 )用热启动法进行 PCR 扩增。标本加热至 75 ℃时加上反应液,覆以盖玻片,四周用指甲油密封。然后将温度升至 95 ℃, 2min 。再将热循环仪设定为 95 ℃, 45s , 55 ℃, 1min 和 75 ℃, 45s ,共 26 次循环;      ( 3 )扩增结束后,在 80 ℃烤 15min ~ 30min 。      3 )原位杂交:      ( 1 )杂交前标本 95 ℃加热 3min ;      ( 2 )加上杂交液,湿盒内 50 ℃过夜; 杂交液组成: 25 %硫酸葡聚糖, 2×SSC , 50 %甲酰胺, 0.33mg/ml 变性的鲑鱼精子 DNA , 每 0 . 5mL 杂交液内含生物素标记探针 1ng 。      ( 3 )扩增的β - 肌动蛋白 和 IL-6 用 DAKO 检测试剂盒 K600( 链霉卵白素,生物素标记的碱性磷酸酶和硝基四氮唑蓝 ) 检测。阳性反应呈紫色。    

 

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