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DNA实验

非放射性Dig-dUTP

2024-10-09 DNA实验 加入收藏
[原理]DNA是通过异羟基洋地黄毒苷(digoxigenin,Dig)配基标记的脱氧尿嘧啶核苷三磷酸(dUTP)随机插入结合而被标记。dUTP通过间臂连结类固

 [原理]

DNA是通过异羟基洋地黄毒苷(digoxigenin,Dig)配基标记的脱氧尿嘧啶核苷三磷酸(dUTP)随机插入结合而被标记。dUTP通过间臂连结类固醇半抗原异羟基洋地黄毒苷酸基,形成Dig-dUTP,杂交反应后,杂交的靶DNA通过酶联免疫法与一个抗体复合物[抗异羟基洋地黄毒苷配基碱性磷酸酶复合物(Dig)Ap]结合,接着在5-溴-4氯-3-吲哚磷酸盐(X-磷酸盐)和硝基四氮唑蓝(NBT)存在下,由酶催化反应,在杂交部位形成蓝紫色带或颗粒。

[操作]

1.转移

通过打点吸渍、噬菌斑或Sonthern印迹转移等方法,把被测的DNA转移到硝酸纤维膜或尼龙膜上。

2.标记探针

取微型离心管于冰上,依次加入:lμg新鲜变性的DNA;2μl六聚核苷酸混合物;2μl dNTP标记用混合物;加无菌双蒸水至 19μL;加 lμl  DNA聚合酶大片段。37℃保温 1小时至20小时,加入 2μl EDTA(0.2 mol/L),终止反应,加 2μL 4mol/L LiCl,75μl预冷的乙醇沉淀DNA,- 70℃ 30分钟或-20℃ 2小时、离心收集沉淀物,真空干燥后加 50μl  TE溶解。

3.预杂交

膜放入袋内 68℃预杂交 1小时,每 100cm2膜至少用 20ml预杂交溶液。

4.杂交

每100cm2膜用2.5 ml杂交液(杂交溶液用预杂交溶液中加新鲜变性的探针组成),68℃至少杂交6小时。

5.洗膜

室温下用50ml 2×SSC, 0.1%(W/V)SDS洗膜,5分钟× 2次,68℃用0.1×SSC, 0.1%(W/V)SDS洗膜,15分钟×2次,晾干。

6.检测

(1)膜在缓冲液中洗涤1分钟。

(2)缓冲液Ⅰ稀释抗体结合物至150 mU/ml(l:5000),稀释后的抗体结合物在4℃只能稳定12小时。

(3)膜在20ml稀释的抗体结合物溶液中保温30分钟。

(4)用缓冲液Ⅰ洗膜15分钟×2次。

(5)在缓冲液Ⅱ中平衡2分钟。

(6)在黑暗条件下,膜与新鲜配制的显色溶液放塑料袋内密封或放入合适的盒子内,几分钟开始显色。

(7)用50ml缓冲液IV洗膜5分钟,终止反应。

(8)摄影记录结果。

[试剂与器材]

1.试剂

DNA稀释缓冲液:Tris.Cl(10mmol/L),EDTA(lmmol/L)pH 8.0,内含鱼精 DNA 50μg/ml。

10×六聚核苷酸反应混合物。

dNTP标记用混合底物:lmmol/L dATP: 1mmol/L dCTP;lmmol/L dGTP;0.65 mmol/L dTTP;0.35mmol/L DigdUTP,pH6.5(20℃)。

DNA聚合酶 I大片段(标记级):2 U/μl。

(Dig)Ap结合物:多克隆抗异羟基洋地黄毒苷配基Fab片段,结合有碱性磷酸酶750 U/ml。

NBT:浓度为 75mg/ml,溶于 70%(V/V)二甲基甲酰胺硝基四氮唑蓝盐溶液。

X-磷酸盐:50mg/ml,溶于二甲基甲酰胺的5-溴-4氯-3-吲哚磷酸盐。

封阻试剂:粉剂

0.2 mol/L EDTA,pH 8.0(20℃)

4mol/L LiCl

70%乙醇

10%(V/V)N-十二烷基肌氨酸钠盐.

10% SDS

20 × SSC

杂交溶液:5×SSC;0.l%(W/V)封阻试剂;0.02%(W/V)SDS。    缓冲液Ⅰ:100 mmol/L Tris-CI;150mmol/L NaCl,PH7.5(20℃)。

缓冲液Ⅱ:0.5 %(W/V)封阻试剂溶于缓冲液中,封阻试剂不会快速溶解,因此应提前1小时配制此溶液,将试剂溶于50~70℃,此溶液保持混浊。

缓冲液Ⅲ:100 mmol/L Tris Cl;100mmol/L NaCl;50mmol/L NaCl;50mmol/L MgCl2,pH9.5(20℃)。

缓冲液IV:10mmol/L Tris Cl;1 mmol/L EDTA,pH 8.0(20℃)。

显色溶液(新鲜配制):10ml缓冲液Ⅲ中,加 45μl NBT溶液和 35μl X-磷酸盐溶液。

2. 器材

常规实验室仪器设备。


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