RAPD
一、 材料 不同来源的DNA(50ng/ul)。二、设备 PCR仪,PCR管或硅化的0.5ml eppendorf管,电泳装置。三、试剂 1、随机引
一、 材料 不同来源的DNA(50ng/ul)。
二、设备 PCR仪,PCR管或硅化的0.5ml eppendorf管,电泳装置。
三、试剂 1、随机引物(10mer) (5umol/L):购买成品。 2、Taq酶:购买成品。 3、10xPCR 缓冲液:配方见第八章。 4、MgCl2 :25mmol/L。 5、dNTP:每种2.5mmol/L。
四、操作步骤: 1. 在25ul反应体系中,加入 模板DNA 1ul (50ng) 随机引物 1ul (约5pmol) 10xPCR Buffer 2.5ul MgCl2 2ul dNTP 2ul Taq酶 1单位(U) 加ddH2O 至 25ul 混匀稍离心, 加一滴矿物油。 2. 在加热至90℃以上的PCR仪中预变性94℃ 2分钟, 然后循环: 94℃ 1分钟, 36℃ 1分钟, 72℃ 1分钟,共40轮循环。 3. 循环结束后, 72℃ 10分钟,4℃保存。 4. 取PCR产物15ul加3ul上样缓冲液(6x)于2% 琼脂糖胶上电泳, 稳压50-100V(电压低带型整齐, 分辨率高)。 5. 电泳结束,观察、拍照。
[注意] 1、电泳时一般RAPD带有5-15条, 大小0.1-2.0kb。2、 特异性的DNA带可以克隆作为一个新的分子标记应用。