天然蛋白的免疫共沉淀方法详解
本方法免疫沉淀得到的天然蛋白可用于 western 免疫印迹或是激酶活性分析
所需溶液和试剂
注意:所有溶液用反渗透去离子水(Reverse Osmosis Deionized water, RODI)或相当纯度的水配制。
1. 20 X 磷酸盐缓冲生理盐水(PBS): (#9808) 配制 1L 1 X PBS 时,取 50 ml 20 X PBS 用 950 ml RODI 水稀释到 1L,混匀。
2. 10 X 细胞裂解液: (#9803) 配制 1 L 1 X 细胞裂解液时,取 100 ml 细胞裂解液加 950 ml RODI 水稀释到 1L,混匀。
注意:使用前添加 1 mM PMSF。
3. 蓝色上样缓冲液(SDS 上样缓冲液):(#7722)。 配制新鲜的 3 X 还原性 SDS 上样缓冲液,在 3X SDS 上样缓冲液中加入十分之一的 30X 的还原剂(1.25M)。
4. 蛋白 A 或 G 琼脂糖微球(用于未标记的一抗):(处理后可以在 4 °C 保存 2 星期)。按照产品说明处理。蛋白 A 用于兔 IgG 抗体的沉淀,蛋白 G 用于小鼠 IgG 抗体的沉淀。
5. 固定有抗生物素蛋白 Streptavidin 的微球(用于生物素标记的抗体): (#3419) 用前稍加震荡,每个免疫下拉反应用 10 μl。
6. 10X 激酶缓冲液:(#9802)配制 1 ml 1X 激酶缓冲液时,取 100 μl 10 X 激酶缓冲液用 900 μl RODI 水稀释到 1 ml,混匀。
7. ATP (10 mM):(#9804)配制 0.5 ml 200 μM ATP 时,取 10 μl ATP(10 mM)加入到 490 μl 1X 激酶缓冲液中。
Preparing Cell Lysates 细胞裂解物制备
1. 吸去培养基。加入含调节因子的新鲜培养基,处理所需的时间。
2. 在非变性条件下收集细胞,去掉培养基,用冰 PBS 清洗一次。
3. 去掉 PBS,每个板(10 cm)中加 0.5 ml 冰预冷的 1 X 细胞裂解液,在冰上孵育 5 分钟。
4. 将所有细胞刮下,收集到一个离心管中。置于冰上。
5. 冰浴中对样品用超声处理 3 次,每次 5 秒钟。
6. 4 °C,14000 X g 离心 10 分钟。将上清转移到新的离心管中,即为细胞裂解物。如有需要,样品可以保存在 - 80°C。
免疫沉淀
细胞裂解物预处理(对于未标记或生物素标记抗体而言是可选步骤)
1. 取 200 μl 1 mg/ml 的细胞裂解物,在其中加入 10~30 μl 50% 的蛋白 A 或 G 琼脂糖微球浆(用于未标记的一抗)或 10 μl 抗生物素链菌素微球(用于生物素标记的抗体)
2. 4 °C 孵育 30 - 60 分钟。
3. 4 °C 离心 10 分钟。将上清转移到新的管中。
4. 根据所用一抗选择下面合适的操作步骤进行实验。
使用未标记一抗
1. 14,000 X g 离心 1 分钟。取 200 μl 1 mg/ml 的细胞裂解物,加入一抗。在 4 °C 转子上孵育过夜。
2. 加入蛋白 A 或 G 琼脂糖微球(10 - 30 μl 50% 微球浆)。4 °C 转子上孵育 1 - 3 个小时。
3. 4 °C 离心 30 秒。沉淀用 500 μl 1 X 细胞裂解液洗五次。每次洗好后都置于冰上。
4. 取沉淀进行 Western 免疫印迹分析或是激酶活性分析。
使用生物素标记的一抗
1. 14,000 X g 离心 1 分钟。取 200 μl 1 mg/ml 的细胞裂解物,加入生物素标记的一抗。在 4 °C 转子上孵育过夜。
2. 稍加震荡。加入固定化抗生物素链菌素(与微球偶联)(#3419)(10μl)。在 4 °C 转子上孵育 2 小时。
3. 4 °C 离心 30 秒。沉淀用 500 μl 1 X 细胞裂解液洗五次。每次洗好后都置于冰上。
4. 取沉淀进行 Western 免疫印迹分析或是激酶活性分析。
使用固定化抗体(与微球偶联)
1. 14,000 X g 离心 1 分钟。取 200 μl 1 mg/ml 的细胞裂解物,加入固定化抗体 10 μl。在 4 °C 转子上孵育过夜。
2. 4 °C 离心 30 秒。沉淀用 500 μl 1 X 细胞裂解液洗五次。每次洗好后都置于冰上。
3. 取沉淀进行 Western 免疫印迹分析或是激酶活性分析。
样品分析
继续下述任一种操作:
Western 免疫印迹分析
1. 将沉淀用 20 μl 3X SDS 上样缓冲液重悬。震荡后离心 30 秒。
2. 把样品放在 95~100 °C 加热 2 - 5 分钟。14,000 X g 离心 1 分钟。
3. 取样 15 - 30 μl 加到 SDS-PAGE 胶(4~20%)上。
4. Western 免疫印迹分析检测(参考 Western Immunoblotting 方法)。
注意:对于分子量约为 50 kDa 的蛋白,我们推荐使用小鼠抗兔 IgG(轻链特异)(L57A3)mAb #3677 或小鼠抗兔 IgG(构象特异)(L27A9)mAb #3678 作为二抗,以减少变性重链产生的遮蔽作用。对于分子量接近 25 kDa 的蛋白,推荐使用小鼠抗兔 IgG(构象特异)(L27A9)mAb #3678。
激酶活性分析
1. 沉淀用 500 μl 1X 激酶缓冲液清洗 2 次。置于冰上。
2. 将沉淀用添加有 200 μM ATP 和底物的 40 μl 1X 激酶缓冲液重悬沉淀。
3. 30 °C 孵育 30 分钟。
4. 加入 20 μl 3X SDS 上样缓冲液终止反应。震荡后离心 30 秒。
5. 将含有磷酸化底物的上清转移到新的管中。
6. 把样品放在 95~100 °C 加热 2 - 5 分钟。14,000 X g 离心 1 分钟。
7. 取样 15~30 μl 加到 SDS-PAGE 胶(4~20%)上。