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DNA实验

克隆化基因的体外转录和翻译实验基本方案

2024-06-08 DNA实验 加入收藏
材料与仪器DNATE 核苷三磷酸混合液 RNA聚合酶缓冲液 异丁醇 NaOH TCA离心机 摇床步骤1. 亚克隆编码蛋白质的目的DNA片段于质粒载体的SP6或


材料与仪器

DNA
TE 核苷三磷酸混合液 RNA聚合酶缓冲液 异丁醇 NaOH TCA
离心机 摇床

步骤

1.  亚克隆编码蛋白质的目的DNA片段于质粒载体的SP6或T7启动子的下游。
 
2.  通过CsCl/溴化乙锭离心或PEG沉淀制备质粒DNA。
 
3.  用位点在终止密码子的立即下游处(理想是50~200碱基)而不存在于蛋白质编码区中的限制性内切酶切割DNA。取小份样品在琼脂糖凝胶电泳中检测。

4.  酚抽提及乙醇沉淀纯化DNA,重溶于50 μl TE缓冲液。
 
5.  在室温建立如下的25 μl 的反应混合液(避免精胺使DNA模板沉淀)
8 μl  H2O
5 μl  DNA
5 μl  5×核苷三磷酸混合液
2.5 μl  10×SP6或T7 RNA聚合酶缓冲液
2.5 μl 10 mmol/l 精胺
1 μl  RNAsin
1 μl  SP6/T7 RNA聚合酶
于40℃保温60 min,如用T7 RNA聚合酶反应,不加精胺,补加2.5 μl 水。
 
6.  加入25 μl 缓冲液平衡酚,振荡混匀,立即抽提。转移水相于一个新微量离心管中,以异丁醇抽提两次。加入6 μl 10 mol/l 乙酸铵和70 μl 乙醇,沉淀RNA并以乙醇洗1次。

7.  重溶RNA于24 μl TE缓冲液,加入6 μl 10 mol/l 乙酸铵和70 μl 乙醇,沉淀RNA并以乙醇洗1次。重溶RNA沉淀于10 μl TE缓沖液,RNA应立即进行体外转录或急冻后存于-70℃。
 
8.  按厂商的说明书往体外翻译试剂盒的配套试剂加入1~10 μl RNA。加入15 μCi[35S]标记甲硫氨酸,典型的反应在30 μl 体枳室温进行30~60 min。反应完成后,可在0~4 ℃保存1周。

9.  取1 μl 翻译反应的产物加入到50 μl 0.1 mol/l NaOH,于37℃放置15 min 加入1 ml,10%TCA在冰上放置15 min。将沉淀收集于玻璃纤维滤膜上,用液闪计数仪测定大量掺入的[35S]甲硫氨酸。

10.  取3 μl 翻译反应产物,用单问SDS-PAGE电泳包括蛋白质分子量标准。用 EN3HANCE荧光自显影使[35S]蛋白质显迹和放射自显彩1~4 h。


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