DNA 的定量与连接反应
药品试剂:
纯化的gusA 片段及pQE31 BamHI/HindIII 片段
1% 6-well agarose gel
DNA 标准分子量 (λMr, 0.5 μg/μL)
方法步骤:
1) 取4 支微量离心管,依下表加入DNA, TE-8.0 及追踪染剂 (μL):
2) 短暂离心混合后,将各管样品置65℃水浴5~10 min 后,移至冰浴降温后进行电泳分析。
3) 将胶体置于UV transilluminator 上观察各色带的亮度,与已知量的 λMr 比较,找出分别与#3, #4 亮度相当的片段。
4) 估计 #3, #4 的DNA 量及计算每 μL 所含的莫耳数。
纯化的gusA 片段与经BamHI/HindIII 作用的pQE31 片段混合后,末端序列互补的部份会进行黏合,但仍须藉由DNA ligase 催化phosphodiester bond 的形成,将缺口接合起来。
仪器用具:12℃恒温槽
药品试剂:
纯化的gusA 片段及pQE31 BamHI/HindIII 片段
T4 DNA ligase (1 U/μL, Invitrogen)
5×T4 DNA ligase buffer (0.25 M Tris-HCl, pH 7.6; 50 mM MgCl2; 5 mM ATP; 5 mM DTT; 25% PEG-8000)
方法步骤:
1) 两种DNA 片段于65℃水浴加热10 min 后,置冰浴中。
2) 取5 支微量离心管置冰浴中,依下表所列 (单位 μL) 依序加入各成份:
* Vector 与insert 的比例为莫耳数比,DNA 总量为100 ng.
3) #1~#4 置于12℃反应过夜,#5 则不加ligase,直接置于4℃冰箱。
4) #1~#4 反应过夜后,以70℃加热10 min,置冰浴中。