DNA电泳常见问题分析
DNA电泳的MARKER怎么是扭曲的?1、 配制胶时的缓冲液需要和电泳缓冲液不是同时配制的.最好是同时配制.电泳时缓冲液高过液面1-2mm即可。
2、 电泳时电压过高,可以在电泳前15分钟用较低电压(3V/cm),等条带出孔后比较漂亮了.然后再调电压。
3、 上样时尽量慢慢加样,等样品自然沉降后再加电压。 跑出的DNA带模糊?1、DNA降解:避免核酸酶污染。
2、 电泳缓冲液陈旧:电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲能力减弱,从而影响电泳效果。建议经常更换电泳缓冲液。
3、 所用电泳条件不合适:电泳时电压不应超过20V/cm,温度<30℃;巨大DNA链电泳,温度应<15℃;核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力。
4、DNA上样量过多:减少凝胶中DNA上样量。
5、DNA样含盐过高:电泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐。
6、 有蛋白污染:电泳前酚抽提去除蛋白。
7、DNA变性:电泳前勿加热,用20mM NaCl缓冲液稀释DNA。 有不规则DNA带迁移?1、 对于λ/Hind III片段cos位点复性:电泳前于65℃加热DNA 5分钟,然后在冰上冷却5分钟。
2、 电泳条件不合适:电泳电压不超过20V/cm;温度<30℃;经常更换电泳缓冲液。
3、DNA变性:以20mM NaCl Buffer稀释DNA,电泳前勿加热。 跑出的DNA条带带弱或无DNA带?1、DNA的上样量不够:增加DNA的上样量;聚丙烯酰胺凝胶电泳比琼脂糖电泳灵敏度稍高,上样量可适当降低。
2、DNA降解:避免DNA的核酸酶污染。
3、DNA走出凝胶:缩短电泳时间,降低电压,增强凝胶浓度。
4、 对于EB染色的DNA,所用光源不合适??应用短波长(254nm)的紫外光源。 跑出的DNA带缺失不完整是怎么回事?1、 如果是小DNA带走出凝胶,可以缩短电泳时间或降低电压或增强凝胶浓度。
2、 分子大小相近的DNA带不易分辨??增加电泳时间,核准正确的凝胶浓度。
3、DNA 变性:电泳前请勿高温加热DNA链,以20mM NaCl Buffer稀释DNA。
DNA链巨大,常规凝胶电泳不合适??在脉冲凝胶电泳上分析。 凝胶回收DNA实验的关键在哪里?最关键的是切胶之后,溶胶的那一步.切胶的时候要尽量把多余的琼脂糖凝胶切干净,按照实验步骤,第一步应该是将胶充分的溶化.这以后步一定要做充分,保证凝胶已经完全溶解了.加乙醇这步也很关键,当凝胶溶解后最好多过几次柱子。
还有就是洗脱的那一步。洗脱的时候最好用加热到60度的洗脱液洗脱,如果实在效果不好可以分两次洗脱。 切胶的时候如何能切的准呢?条带的位置肉眼很难判断出来,如何判断条带的位置呢?可以将产物与Marker一起电泳,染色后,在紫外灯下观察结果,跟Marker进行相比,就知道要的是哪条带。注意,紫外灯下切胶速度要快,否则DNA会降解,另外,紫外线对身体伤害很大,特别是眼睛,请注意采取保护措施(比如在专门的箱子里切,带眼镜等)。
RNA 用具要用10%的NaOH浸泡过液,再用DEPC水冲洗干净70%的乙醇用过 国产分析乙醇有杂质,RNA酶还会有,并带入其它污染。