细胞短串联重复序列鉴定的重要性

短串联重复序列（short tandem repeat，STR），又称为微卫星DNA ，重复单位为2-6bp，重复次数10~60多次，在DNA复制过程中的滑动、复制、修复过程中滑动链与互补链的碱基错配，从而导致一个或几个重复单位的缺失或插入，形成STR的多态性，主要应用于遗传连锁图谱分析、家系鉴定、身份认证等领域，同时也是鉴定细胞株被错误识别和交叉污染的主要工具。细胞株被错误识别及交叉污染的现象还是比较普遍的，虽然科研工作者使用各种各样的传统方法来鉴定细胞，但细胞交叉污染的问题却有增无减。甚至有些科研工作者在发表分数比较高的文章时，需补充细胞鉴定报告，这时发现细胞株存被错误识别或者有交叉污染，从而导致错误的结论，造成大量研究经费及时间的浪费，并产生了大量无效或错误数据，对其他科研工作者产生误导。据统计，国外实验室有20%左右的细胞株被错误鉴定和交叉污染，因此对细胞株进行准确鉴定和污染鉴定对研究者来说是必须正式、严肃关注的事情。2007年NIH针对这一情况发布了通知，强烈建议在使用培养细胞的时候进行鉴定。2008年底，专家提议ATCC致力于人源细胞系的鉴定工作，并制定鉴定的标准程序。目前已开发出20个稳定，且具有多态性的STR位点，即D5S818、D13S317、D7S820、D16S539、vWA、TH01、AMEL、TPOX、CSF1PO、FGA、D18S51、D21S11、D8S1179、Penta E、D3S1358、Penta D、D19S433、D6S1043、D12S391和D2S1338。同时分析超过15个STR基因座，可以准确判断交叉污染和细胞类型；而且灵敏度高，可以检测最低至0.1ng DNA(约15个二倍体基因组)，微量污染也可检测；同时具有高通量和系统化平台，日处理量上千个检测，数据分析比对采用自动化软件分析系统。此外北京阅微基因技术有限公司作为ATCC标准委员会成员，在国内率先推出了细胞STR鉴定服务并与多家研究机构、细胞中心、生产厂商等建立长期合作关系。并通过自己的专利产品开发出小鼠基因组中8个高度多态性位点，可用于人鼠细胞株交叉污染的鉴定。推动的细胞STR鉴定的发展进程。细胞STR鉴定主要应用于将人源细胞系用于研究和生产的用户，包括但不限于以下领域：医学，遗传学，药物开发，疫苗研制，生物技术和制药行业，再生医学，基础科学，HIV的检测和治疗以及细胞生物学等领域。现有的细胞STR分型技术已经很成熟，在此呼吁各界的细胞相关的科研工作者，要定期对自己研究的细胞株进行STR鉴定，确保实验结果的准确性。