PCR实验操作
PCR是极为重要的DNA增殖技术,应用层面非常广,其中包括了核酸探针的制备。如果一段DNA已经被次选殖至载体上,要以PCR扩增这段DNA时,可根据质体multiple cloning sites两边的序列,选用适当的核酸引子 (universal primers) 进行扩增反应;比较常用的引子包括SP6, T3 与T7 promoter primer, M13/pUCforward与reverse primers等;若有特殊考量,也可以使用序列专一性核酸引子对。进行PCR反应时若同时添加 [α-32P]dNTP或DIG-11-dUTP,所增殖的DNA即被32P或DIG所标定,所以PCR是制备核酸探针非常便捷好用的方法。
仪器用具:微量离心机;PCR 反应器
药品试剂:
模版DNA: pBlueGus 质体DNA (~50 pg)
核酸引子对: T3 promoter primer 与T7 promoter primer (各2 μM)
矿物油 (是否需要视PCR反应器机型而定)
PCR DIG probe synthesis kit (Roche), 内含:
Taq DNA polymerase (Expand High Fidelity, 3.5 U/μL)
10×PCR DIG probe synthesis mix (2 mM dATP, dCTP, dGTP, 1.9 mM dTTP,及0.1 mM DIG-11-dUTP, pH 7.0)
Expand high fidelity buffer with MgCl2 (10×)
方法步骤:
以下反应条件主要参照PCR DIG probe synthesis kit 制造厂商所提供的产品说明。
1) 取一支0.5 mL微量离心管,依下表逐一加入各项试剂 (单位 μL):