PCR技术(PCR ,Polymerase chain reaction)
PCR (Polymerase chain reaction) 是用一对寡聚DNA作为引物,通过加温变性-退火-DNA合成这一周期的多次循环,使目的DNA片段得到扩增。由于这种扩增产物是以指数形式积累的,经25-30个循环后,扩增倍数可达106。Dr. Karry Mullis 1985年发明,获1993年度诺贝尔化学奖;
(一)基本要素
1、Taq DNA聚合酶:
水生栖热菌(thermus aquaticus,Taq)的DNA聚合酶
①5’→3’DNA聚合酶活性; ②无3’→5’外切酶活性, 35轮0.25%错配,与原始模板有差别; 最适聚合酶 温度72℃,选择72℃延伸 半衰期:92.5℃ 130mi 95℃ 40min 97.5℃5—6min 变性温度:≤95℃使其在整个扩增循环中保持足够活性
pfu DNA 聚合酶
耐热 5’→3’DNA聚合酶活性 3’→5’外切酶活性 精确度:pfu >Taq 但pfu扩增效率通常比Taq酶略 文献报道:Taq+pfu 会起到较好效果
2、Primer 本身不要出现内部互补序列形成loop环,内部二级结构如: GGGTCGATTCCTACCCATGC
注意减少Primer间互补序列导致2个Primer形成dimer一般不要超过3个互补bp
Primer 5’未端可修饰、突变:修饰,如:32P、生物素、荧光素,不影响其效果;突变:AGCTCCATGACCCAG 5’CGCTCCATGACCCAG 3‘
注意:绝不可以在3’端进行上述改造
∵DNA聚合酶是5’→3’聚合,若3’端改造→不能互补→不能延伸
primer 5’端增加碱基 ATG起始密码 TAA、TAG、TGA终止密码 如:可溶性受体的表达,无膜内区、穿膜区,只有膜外区。
3、模板:
可选:DNA mRNA→逆转录→cDNA DNA包括: 质粒 噬菌体 染色体DNA 较小 较大 ①目的gene是单拷贝 变性较易 变性较难 ②非常大,变性难 模板用量 Plasmid:lng Chromosome:300-500ng 注意: 防止交叉污染