微量和特殊标本DNA PCR反应模板的制备
一、血斑标本操作方法
1. 将血斑剪碎,置于试管中;
2. 加1.8ml TES液(含0.15mol/L NaCl,10mmol/L Tris-HCl,pH7.5,1mmol/L EDTA)浸泡10min;
3. 加10% SDS 180μl和蛋白酶K(10U)25μl,50℃过夜;
4. 用等体积的饱和酚和氯仿各抽提两次;
5. 上清液加2.5倍体积的无水冷乙醇沉淀DNA;
6. 70%冷乙醇洗1次;
7. 干燥后,溶于适量TE液中;
8. 取适量样品进行PCR扩增。
二、精液标本操作方法
1. 将精液静置30min,使其液化;
2. 用5×PBS洗3次;
3. 将精子悬浮于25% Percoil液中;
4. 离心,500r/min 5min后,悬浮于1×PBS中;
5. 将精子悬浮于1×PCR缓冲液(含有0.05mg/ml蛋白酶K,20mmol/L DTT 1.7μmol/L SDS)中;
6. 37℃温育1h后,85℃灭活蛋白酶K;
7. 取适量样品进行PCR扩增。
三、绒毛标本操作方法
1. 将绒毛样本离心2min,使样品沉淀于管底;
2. 用缓冲液(100mmol/L NaCl, 10mmol/L Tris-HCl,pH 8.0, 1mmol/L EDTA)洗涤两次;
3. 重悬于50μl裂解液(0.1mol/L NaOH, 2 mol/L NaCl和0.5% SDS)中振荡裂解;
4. 煮沸2min,离心10min去沉淀;
4. 取2.5μl上清进行PCR扩增。
四、羊水标本操作方法
1. 取1.5ml羊水置于离心管中,离心5min;
2. 弃上清,将细胞团用TE缓冲液洗涤1次;
3. 于沉淀细胞中加入50μl裂解液(0.1mol/L NaOH,2mol/L NaCl),振荡裂解;
4. 煮沸2min,并再次振荡;
5. 离心10min,去细胞碎片;
6. 取2.5μl上清进行PCR扩增。
五、口腔上皮细胞标本操作方法
1. 用15ml生理盐水漱口10s,置液体于试管中;
2. 2000r/min离心10min;
3. 加1ml TES和10%SDS 100μl;
4. 55℃消化2h;
5. 用等体积的饱和酚和氯仿各抽提2次;
6. 预冷的无水乙醇沉淀DNA;
7. 70%无水乙醇洗涤一次;
8. 真空干燥,溶于适量的TE液中
9. 适量样品进行PCR扩增。
六、尿样标本操作方法
1. 将尿样3000r/min离心5min,弃沉淀,取上清2~5μl即可直接进行PCR扩增。
但由于尿液中往往存在DNA聚合酶的抑制物。直接用尿液扩增会产生一定的假阳性。为了避免这种情况,可进行下列处理。
2. 取尿液400μl,3000r/min离心5min;
3. 取上清液,加入10% SDS使终浓度达0.1%,37℃保温30min;
4. 加入等体积的苯酚,充分振荡后,7000r/min离心10min,取上清;
5. 用苯酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)和氯仿/异戊醇(24:1)混合液再同样各抽提一次;
6. 取上清400μl,加入5μl糖原(10mg/ml),1/10体积的3mol/L NaAC(pH 5.5)和2.5体积的乙醇,-20℃过夜;
7. 12000r/min离心20min弃上清,75%乙醇洗涤两次;
8. 用TE溶解沉淀,取适量样品进行PCR扩增。
七、耳血标本操作方法
1. 血两滴(30~100μl),置微量离心管中,加1ml 1×SSC,4000g离心1min;
2. 弃上清,加1ml双蒸水,混匀,立即加入0.25ml 5×SSC,5000g离心1min;
3. 弃上清,加3mol NaAc(pH5.2)0.2ml,20μl 10%SDS,混匀;
4. 用等体积的饱和酚,氯仿各自抽提两次,上清液加预冷的2.5倍体积的无水乙醇和1/10体积的3mol NaAc(pH5.2),沉淀DNA;
5. 70%乙醇洗一次,干燥;
6. 溶于10~20μlTE缓冲液(pH8.0)。