PCR-SSP分析实验

根据决定某等位基因的碱基性质，设计3′端第一个碱基分别与各等位基因的特异性碱基相匹配的序列特异性引物，在PCR 反应过程中，只有引物3′端第一个碱基与决定特定等位基因的碱基互补时才能实现DNA 片段的完全复制，根据PCR 产物的有无进行等位基因的分型。

模板DNA
Taq 聚合酶 丙烯酰胺 电极缓冲液 上样缓冲液
PCR 扩增仪 电泳仪 电泳槽

1.PCR扩增PCR反应体系为20μl（2个体系，分别为引物1和引物2），含模板2μl(约50ng)，引物各1.5μl,dNTP1.6μl(0.4mM)，10×Buffer缓冲液2μl，Taq酶1.0U，加双蒸水至20.0μl；PCR反应条件为94℃4min,94℃1.5min/52℃2.0min/72℃2.0min，30个循环。

2.PCR 扩增产物的检测 取PCR 扩增产物2μl，6%聚丙烯酰胺凝胶电泳（T=6%，C=3.3%，凝胶规格为82mm×64mm×0.75mm）。电极缓冲液为1×TBE。将加有1/5 体积上样缓冲液的酶切产物电泳，220 v 电压，电泳2－3h。银染显色

①如引物结合序列存在碱基变异可能无扩增产物，导致错误判型；②在对照样品分型准确的基础上才能判定结果。

1、如引物结合序列存在碱基变异可能无扩增产物，导致错误判型。

2、在对照样品分型准确的基础上才能判定结果。

该方法操作简单，引物设计与实验的复性条件要求较高。