基因组文库的扩增实验
原理通过平板培养可对重组噬菌体文库进行扩增,平板培养的原种可直接来源于本方案所述的包装混合物。但只要可能,该扩增过程可被省略,而感兴趣的 DNA 序列可从原始文
原理
通过平板培养可对重组噬菌体文库进行扩增,平板培养的原种可直接来源于本方案所述的包装混合物。但只要可能,该扩增过程可被省略,而感兴趣的 DNA 序列可从原始文库直接筛选。扩增将不可避免地降低文库的复杂性,部分原因在于在连续几轮的噬菌体生长中,对生长缓慢的重组噬菌体来说是十分不利的。
材料与仪器
λ 噬菌体文库 大肠杆菌铺平扳细菌
氯仿 SM
LB 或 NZCYM 琼脂平板 Sorvall SS-34 或相当型号 加热设备或水浴
氯仿 SM
LB 或 NZCYM 琼脂平板 Sorvall SS-34 或相当型号 加热设备或水浴
步骤
一、材料
1. 缓冲液和溶液
氯仿
SM
2. 培养基
LB 或 NZCYM 琼脂平板(150 mm)
LB 或 NZCYM 顶层琼脂糖
3. 离心机和转子
Sorvall SS-34 或相当型号
4. 专用设备
预置于 47℃ 的加热设备或水浴(用于顶层琼脂糖)
5. 载体和菌株
λ 噬菌体文库
大肠杆菌铺平扳细菌
二、方法
1. 为了扩增 λ 噬菌体文库,将含 10000~20000 个重组噬菌体的 50 μl 或更少体积的多个包装混合物组分与 0.2 ml 铺平板细菌在 13X100 mm 试管中混匀,37℃ 温育 20 min。
2. 加 6.5 ml 已熔化的 47℃ 的琼脂或琼脂糖至感染细胞的第一个试管中,通过轻拍或温和地涡旋振荡混匀,立即倒入新鲜灌制的 150 mm 平板内的底层琼脂上。对余下的感染细胞重复该过程。
3. 将平板于 37℃ 最长放置 8~10 h。
4. 将平板中加入 12 ml SM ( 如果用烤盘,则加 150 ml), 4℃ 水平放置过夜。
5. 将所有平板中的 SM 都收集至一个单独的无菌聚丙烯离心管或瓶子中。每个平板再加 4 ml SM 进行冲洗,与最初回收的 SM 液合并。加入 0.2 ml 氯仿至回收的扩增噬菌体培养物中,室温放置 15 min,并偶尔轻轻摇晃使氯仿裂解所有的感染细胞。
6. 4℃ 4000 g ( 5800 r/min 在 Sorvall SS-34 中)离心 5 min,去掉细胞和琼脂糖碎片。
7. 将上清转移至新的无菌试管或瓶子中。将扩增噬菌体文库分成数个组分,4℃ 保存。用噬菌斑分析测定文库滴度。
1. 缓冲液和溶液
氯仿
SM
2. 培养基
LB 或 NZCYM 琼脂平板(150 mm)
LB 或 NZCYM 顶层琼脂糖
3. 离心机和转子
Sorvall SS-34 或相当型号
4. 专用设备
预置于 47℃ 的加热设备或水浴(用于顶层琼脂糖)
5. 载体和菌株
λ 噬菌体文库
大肠杆菌铺平扳细菌
二、方法
1. 为了扩增 λ 噬菌体文库,将含 10000~20000 个重组噬菌体的 50 μl 或更少体积的多个包装混合物组分与 0.2 ml 铺平板细菌在 13X100 mm 试管中混匀,37℃ 温育 20 min。
2. 加 6.5 ml 已熔化的 47℃ 的琼脂或琼脂糖至感染细胞的第一个试管中,通过轻拍或温和地涡旋振荡混匀,立即倒入新鲜灌制的 150 mm 平板内的底层琼脂上。对余下的感染细胞重复该过程。
3. 将平板于 37℃ 最长放置 8~10 h。
4. 将平板中加入 12 ml SM ( 如果用烤盘,则加 150 ml), 4℃ 水平放置过夜。
5. 将所有平板中的 SM 都收集至一个单独的无菌聚丙烯离心管或瓶子中。每个平板再加 4 ml SM 进行冲洗,与最初回收的 SM 液合并。加入 0.2 ml 氯仿至回收的扩增噬菌体培养物中,室温放置 15 min,并偶尔轻轻摇晃使氯仿裂解所有的感染细胞。
6. 4℃ 4000 g ( 5800 r/min 在 Sorvall SS-34 中)离心 5 min,去掉细胞和琼脂糖碎片。
7. 将上清转移至新的无菌试管或瓶子中。将扩增噬菌体文库分成数个组分,4℃ 保存。用噬菌斑分析测定文库滴度。