克隆心得—帮助新手快速做出克隆
本方法的核心部分是医科院基础所的生化脂蛋白组的吴刚老师所创,我在其基础上进行了一些改动,主要是DNA回收上采取了更简单的方法。(本方法最适用于双酶切制作片断并进
本方法的核心部分是医科院基础所的生化脂蛋白组的吴刚老师所创,我在其基础上进行了一些改动,主要是DNA回收上采取了更简单的方法。(本方法最适用于双酶切制作片断并进行克隆 的情况。对于分步酶切制作片断,也可以使用本方法,但需要加倍起始酶切DNA的量。)
一、片断平移的克隆 (也适用于多片断连接)
简介:将用作载体的质粒A(制作大片断)酶切3μL ,要切出小片断的质粒B酶切7μL;琼脂糖回收胶电泳;切胶回收来自质粒A的大片段,和来自B的小片断,并回收到一管中;酚氯仿法回收DNA,酒精沉淀,干燥;加入8μL水、1μLligase Buffer、1μL ligase ,4℃过夜;次日转化涂板。
酶切
配置可酶切共10μL质粒的酶切反应体系(双酶切):
(提示 在克隆 设计时尽量使用好切的内切酶<通常是效价高、便宜量大的酶>,且注意这两个酶有比较兼容的Buffer,即在这种公用Buffer中,两酶的效力变化不大<至少保持60%的活性>。酶切体系根据需要,可加入BSA。)
酶切体系
A质粒酶切-制作载体片断
公用Buffer 3μL
酶 I 1μL
酶 II 1μL
质粒 3μL
双蒸水 22μL
合计 30μL
B质粒酶切-制作插入片断
公用Buffer 7μL
酶 I 2μL
酶 II 2μL
质粒 7μL
双蒸水 52μL
合计 70μL
混匀
37℃,酶切3小时。
(提示 关于酶量的问题。通常的内切酶效价在10U/μL左右,3μL内切酶相当于30U,足够切10μL的质粒。因为通常小提质粒的浓度在200-600ng/μL,一般浓度达不到1μg/μL。根据1U酶切1μg质粒的原则,这一酶量是足够的。)
1%琼脂糖回收胶回收(碎胶、酚氯仿抽提法)