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RNA实验

RNA抽提指南(TRIZOL法)

2024-10-31 RNA实验 加入收藏
RNA抽提指南(TRIZOL法)注意事项:* 全程佩戴一次性手套。皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成为RNA酶的来源。培养良好的微生物实验操作习惯

RNA抽提指南(TRIZOL法)

注意事项:

* 全程佩戴一次性手套。皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成为RNA酶的来源。培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。

* 使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA,避免使用公共仪器所导致的RNA酶交叉污染。例如,使用RNA探针的实验室可能用RNA酶A 或T1来降低滤纸上的背景,因而某些非一次性的物品(如自动吸管)可能富含RNA酶。

* 在TRIZOL 中,RNA 是隔离在RNA 酶污染之外的。而对样品的后续操作会要求用无RNA 酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿。玻璃器皿可以在150°C 的烘箱中烘烤4 小时。塑料器皿可以在0.5 M NaOH 中浸泡10 分钟,用水彻底漂洗干净后高压灭菌备用。

抽提步骤:

1.匀浆化作用

通过离心来沉淀细胞后,弃上清,用移液管加TRIZOL试剂反复吹打来裂解细胞至均一通亮的液态后,将匀浆样品在15―30°C 条件下孵育5 分钟以使核蛋白体完全分解。

(每5―10×106的动物细胞,植物或酵母菌细胞或每1×107 细菌加1ml的TRIZOL。在加入TRIZOL前应避免洗涤细胞因为那样会增加mRNA降解的可能性。)

2.分离阶段

每1 mlTRIZOL 加0.2 ml 氯仿。盖紧样品管盖,用手用力摇晃试管15 秒并将其在30°C 下孵育2―3 分钟。在2―8°C 下以不超过12,000×g 的离心力高速冷冻离心15 分钟。离心后混合物分成三层:下层红色的苯酚-氯仿层,中间层,上层无色的水样层。RNA 无一例外地存在于水样层当中。水样层的容量大约为所加TRIZOL 容量的60%

3.RNA的沉淀

将水样层转移到一干净的试管中,通过将水样层和异丙醇混合来沉淀RNA。最初均化时的每1 mlTRIZOL 对应0.5 ml 异丙醇。将混合的样品在 15―30°C 条件下孵育10 分钟并在2―8°C 下以不超过12,000×g 的离心力高速冷冻离心10 分钟。RNA沉淀在离心前通常不可见,形成一胶状片状沉淀附着于试管壁和管底。

(如果希望分离DNA 和蛋白,有机层同样要予以保留。在除去水样层后,样品中的DNA 和蛋白也能相继以沉淀的方式还原。乙醇沉淀能析出中间层的DNA,在有机层中加入异丙醇能沉淀出蛋白。共纯化DNA 对于样品间标准化RNA 的产量十分有用。)

4.RNA的洗脱

移去上层悬液。用75%的乙醇洗涤RNA 沉淀一次,每1 ml 的TRIZOL 至少加1 ml 的75%乙醇。旋涡振荡混合样品并在2―8°C 下以不超过7,500×g的离心力高速冷冻离心5 分钟。

5.RNA的再溶解

在操作的最后,简单干燥RNA沉淀。尤为重要的是,不能让RNA沉淀完全干燥那

样会极大地降低它的可溶性。部分溶解的RNA样品其A260/280 比值< 1.6。用移液管尖分几次移取无RNA酶的水或0.5% SDS溶液来溶解RNA,并在55―60°C下孵育10 分钟。

TRIzol法抽提总RNA 组织100mg ↓ 加1mlTRIzol ↓ 匀浆(要彻底,后转至EP管) (组织匀浆量>100mg时分装1ml/每EP管) ↓ 颠倒混匀10下,室温5分钟(30°C孵育) ↓ 加氯仿1/5体积(0.2ml)(必须按总体积的1/5) ↓ 颠倒混匀15S,室温2-5分钟(30°C孵育) ↓ 4℃,离心12000g,15分钟 ↓ 转上层水相(约400μl)于另一1.5mlEP管中 ↓ 加等体积异丙醇(约400 -500μl),混匀室温10分钟 ↓ 4℃,离心12000g,10分钟(30°C孵育) ↓ 弃上清 ↓ 加冰预冷的75%乙醇(用DEPC水配)1ml ↓ 4℃离心7500g,5分钟 ↓ 弃上清,空气干燥5-10分钟(不能完全干燥) ↓ 溶于DEPC水中至20μl(10μl-20μl) (可在55-60℃水中,<10分钟助溶)


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