单细胞miRNA表达谱
miRNA 是一类22 碱基左右的非编码RNA,能够被整合到沉默复合体(RISC)中,使碱基互补的目标mRNA 沉默或降解,以实现其调控作用,与生物正常的生长发育以及各种疾病如癌症和心血管疾病等的发生都有着密切的关系。 单细胞miRNA表达解决方案 启因生物独家引进美国NanoString公司的多基因表达计数系统nCounter assay system,它仅需100 ng的RNA
即可对逾八百个特异的mRNA转录子进行准确的定量;它无需酶促和扩增过程,其检测的敏感性和准确性与实时荧光定量PCR(RT—PCR)技术相当。检测系统包括样品制备工作站和数据分析仪,流程包括杂交、纯化固定、计数三个步骤。
检测特点:
精度和准确度:无需扩增,灵敏性和特异性高,并且准确识别度高,可以准确区分高度相似的miRNA;
转录覆盖面全面:全面的代码集可供人类、小鼠、大鼠和果蝇等的miRNA转录,并且每24小时可快速提供96个样品的上千万数据;
兼容性强:总RNA,石蜡包埋组织总RNA;
可定制:标准-miRBase 覆盖版设置,条形码设置; 样本来源:除了可对多种来源组织细胞提纯的核酸进行定量,还可对新鲜或冻存组织、细胞、细菌等的裂解物以及多聚甲醛固定石蜡包埋(formalin—fixed paraffin.embedded,FFPE)组织细胞的裂解物等直接进行定量检测。
nCounter技术能够高通量的检测800 多种人和人-病毒miRNA、600 余种小鼠miRNA 和400 余种大鼠 miRNA 以及184种果蝇miRNA,并进行图谱分析,而其灵敏度和特异性更与qPCR 相当; 检测原理:一段特殊的桥接寡核苷酸(bridge oligo)分别特异的结合目标miRNA 和其对应的miRtag,并使两者共价连接,经过变性,miRNA:miRtag 复合物成为一条单链,这个复合物能够和特定的捕获探针、报告探针结合,并像普通的mRNA 一样被定量检测。
miRNA表达谱高水平的敏感性、特异性、精度和线性度等使其广泛应用在肿瘤、神经生物学、发育生物学、干细胞等领域的研究。