RNA提取的流毒非浅的经典误区(RNA提取的实践指南)
最近碰到了好几个RNA提取的初学者来实验室学习如何提取RNA,对于如此简单的操作,却有如此多的人提取不出来,细问一下,原来他们的知识来源都是书本上或者网上的“RNA提取注意事项一类”的所谓经验,其实,他们提取不出来的真正原因。
恰恰是他们严格遵守了所谓的经验,精力全放在不需要注意的地方,结果搞得自己很紧张, 真正需要注意的操作反而没有注意了。
下面我就结合网上常见的RNA 操作注意事项与实验技巧的文章指出提取RNA的流毒非浅的常见误区:1.“ 如果可能,实验室应辟出专门RNA操作区,离心机、移液枪、试剂等均应专用。RNA操作区应保持清洁,并定期进行消毒。”
完全错误,任何普通的试验台,不需要任何消毒,暴露在空气中就可以。用我的话说就是垃圾堆里面我都可以提取出RNA!有的学生告诉我他们在哪里提取的, 他们在超净台里面操作,只有两个孔伸手进去,操作及其不便,还容易使人疲劳,风干RNA沉淀的时候,也看不清楚,常常造成要么干过头,要么乙醇残留高。
空气中有RNA酶污染,还到处乱飘,还会到离心管子里面降解RNA,谁告诉你的?你看见了?你做过实验了?人家说啥你就信?如果真是这样空气到处飘RNA酶,你的电泳槽,电泳仪,电泳液总不可能放到超净台电泳吧?
你配制电泳缓冲液总不能不暴露在空气中吧?电泳液体,电泳槽不知道早就被飘进多少RNA酶了,那还怎么跑电泳,全部降解!可能嘛?更何况超净台空气净化过滤的是细菌大东西,RNA酶蛋白分子那么小它能过滤得掉嘛,所以如果空气中有RNA酶,超净台也挡不住的。稍微分析一下就明白了。
实际上,随便啥普通实验室的试验台提取RNA,几百次了,从未因为没有在超净台提取就降解RNA的。
2.“操作过程中应自始至终佩戴抛弃式橡胶或乳胶手套,并经常更换,以避免将手、臂上的细菌和真菌以及人体自身分泌的RNA酶带入试管或污染用具。尽量避免使用抛弃式塑料手套。塑料手套不贴身,常常造成操作不便,而且多出部分还容易在器具上遭RNA酶污染并向未污染处传递,扩大污染。”
这是流传最广的错误,因为手上的RNA酶,按照正常的操作,怎么可能带到离心管里面?即使沾到离心管壁外面了,对里面的RNA也完全没有影响啊。难道你是崂山道士,不带手套抓住离心管子,手上RNA酶可以透过塑料管穿墙过去降解RNA?
如果你有这个本事,塑料管子都可以穿透,再戴个手套那不也可以穿透?穿2条裤子放屁和穿一条裤子放屁一样挡不住污染大气-多此一举。如果说你不戴手套,你手上的RNA酶多到可以随时掉下来,掉渣,掉到离心管子里面。那不是提取RNA的问题,那是卫生问题,你该洗手或者洗澡了。
除非有人参观,我一般提取RNA根本不注意是否带了手套,戴手套也是为了保护手不沾到苯酚,氯仿。 而不是怕污染。至于扩大污染一说, 完全是胡扯,试验台上早就到处是飞沫,手接触后留下的RNA酶,早就污染完全了,再说,还是我刚才说的,它们怎么可能转到小离心管里面?3.“研钵去干烤”。
不需要,洗干净,晾干就可以了,即使里面有一些RNA酶残留,有液氮的时候如此低的温度下怎么可能降解RNA,转到裂解液后,外源,内源的RNA酶就会被全部抑制。
何况,组织里面那么多的内源性RNA酶研磨的时候都不会降解RNA,残留一点在研钵上的RNA酶就会吗?实际操作,研钵洗干净(避免交叉污染就行),然后晾干,或者用纸擦干就直接用了。残留一点不会影响。4.“操作时候戴口罩,帽子,不说话”。
不需要, 除非你提取的时候唾沫横飞, 而且特别准确,有一滴飞入了你手上拿的1.5毫升的离心管。总之,我边提取的时候, 边要和学生大谈,提取RNA如何如何的简单。5.“用DEPC处理枪头, 小离心管”。
不需要,国外的枪头,离心管散装的,装好在枪头盒里面 ,直接可以用,不需要高压灭菌。国产的我用得不多, 反正我买过浙江产的2分钱一个的离心管,照样不需要DEPC处理,不需要高压,打开了,直接用。
总之做不出来, 首先千万不要找枪头,离心管是国产质量不好的原因。道理很简单,高温高压生产线的塑料管子早就经历了几百度高温的融浆状态,早就RNA酶灭活干净了。
退一万步,即使污染了RNA酶,至少和裂解液接触的枪头离心管子全部不用处理吧?。举个例子,如果用一个污染了RNA酶的枪头去吸取裂解液,会发生下面哪种情况:1.枪头把RNA提取裂解液污染了。2.裂解液把枪头RNA酶给灭活了。想想内源性提取的细胞的那么多RNA都可以被裂解液灭活好好的。枪头一点污染能不灭活?
大家想一下, 当大家经过了网上如此繁琐的错误的注意事项洗礼的时候,他还能有精力去注意提取RNA的重点和真正应该注意的东西在什么地方吗?其实,真正应该注意的就是。。。。。。,我累了,下次说。北京艾德莱生物张老师,RNA提取专家欢迎和大家的交流。