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微生物学

肠道感染病毒标本的采集与处理

2024-04-18 微生物学 加入收藏
简介胃肠道病毒(enterovirus,EV)首先在人肠道中复制,但很少引起胃肠道症状,临床表现主要为以消化道为原发灶的全身感染。EV感染以隐性感染多见,婴幼儿

简介

胃肠道病毒(enterovirus,EV)首先在人肠道中复制,但很少引起胃肠道症状,临床表现主要为以消化道为原发灶的全身感染。EV感染以隐性感染多见,婴幼儿、免疫力低下的成人易感。尽管同一种EV可引起不同临床表现,而不同EV也可引起相同症状。


但通常来说,特有的临床表现常与特定的肠道病毒感染相关联。例如,急性出血性结膜炎(acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)通常是由柯萨奇病毒A24变种(CV-A24v)或肠道病毒70(EV-D70)引起;急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)通常是由脊髓灰质炎病毒和肠道病毒71(EV-A71)引起。
胃肠道病毒标本采集用于EV核酸检测、病毒分离鉴定的标本主要为患者的粪便、咽拭子和疱疹液等临床标本,如患者出现神经系统症状,则应采集脑脊液标本。


急性出血性结膜炎患者应采集结膜拭子或结膜刮取物标本。血清学诊断时,需要采集患者急性期和恢复期的双份血清标本。

材料与仪器

器材:
①一次性无菌手套
②采集管


试剂:
①材料:采集标本
②标本缓冲液

步骤

肠道感染病毒标本的采集与处理根据样本类型,其基本过程可分为如下几种:


一、肠道感染病毒标本的采集


(1)粪便标本:采集患者发病7日内的粪便标本。粪便标本采集量为5~8 g/份,采集后应立即放入无菌采便管内,4 ℃保存,立即(24小时内)送达实验室,需长期保存的标本应存于-70 ℃冰箱中。


(2)咽拭子标本:采集患者发病3日内的咽拭子标本。用专用采样棉签,适度用力拭抹咽后壁和两侧扁桃体部位,应避免触及舌部;迅速将棉签放入装有3~5ml保存液的保存管中,保存液配方为91.5 ml Eagle's MEM 中加入青霉素和链霉素(终浓度为:青霉素100 U/ml,链霉素为100 μg/ml)、胎牛血清(终浓度为2% )、3.5 ml 7.5% NaHCO3、1 mlL-谷氨酰胺溶液、1 ml 1 mol/L的HEPES溶液。在靠近顶端处折断棉签杆,旋紧管盖并密封,以防标本干燥。4 ℃保存,立即(12小时内)送达实验室,-20 ℃以下低温冷冻保存,需长期保存的标本应存于-70 ℃冰箱中。


(3)血清标本:采集急性期血清(发病0~7天)检测相应EV-IgM抗体可用于早期临床诊断,采集急性期(发病0~7天)和恢复期(发病14~30天)双份配对血清检测IgG或中和抗体,可用于回顾性诊断。静脉采集3~5 ml全血,置于真空无菌采血管中,自凝后,分离血清,将血清置于-20 ℃以下冰箱中冷冻保存。


(4)疱疹液:采集急性期疱疹液时,应先用75%的酒精对疱疹周围的皮肤进行消毒,然后用消毒针将疱疹挑破,用棉签蘸取疱疹液,迅速将棉签放入内装有3~5 ml病毒保存液的采样管中,在靠近顶端处折断棉签杆,旋紧管盖并密封。所采集标本4 ℃保存,立即(12小时内)送达实验室,-20 ℃以下低温冷冻保存,需长期保存的标本应存于-70 ℃冰箱中。


(5)脑脊液标本:脑脊液可用于抗体检测、核酸检测或病毒分离。出现神经系统症状的病例,应采集脑脊液标本;采集时间为出现神经系统症状后3天内,采集量为1.0~2.0 ml。标本采集后立即装入无菌带垫圈的冻存管中,4 ℃保存,立即(12小时内)送达实验室,需长期保存的标本应存于-80 ℃冰箱中。


(6)患者眼结膜拭子或结膜刮取物标本:对于急性出血性结膜炎患者,患者眼结膜拭子或结膜刮取物是核酸检测或病毒分离CV-A24v、EV-D70的主要标本。标本应在起病1~3天内采集。用灭菌棉拭子涂擦翻转的上、下睑结膜并拭取泪液后,应立即投入装有病毒保存液标本采集管中,贴好标签,置冰壶内携至实验室或低温(-70 ℃以下)冻存。


二、肠道感染病毒标本的处理


(1)粪便标本:由于粪便标本成分较为复杂,含有的细菌、真菌、毒素等成分可干扰后续的EV病毒分离培养以及EV核酸直接检测。粪便标本应事先用三氯甲烷进行处理,然后用于EV的病原学检测。三氯甲烷处理过程可灭活有包膜的微生物(细菌、真菌、含包膜病毒等),以及大部分脂溶性毒素,并充分分散聚集成团的EV。


操作过程及步骤:


①在生物安全柜中,取约2 g粪便标本、10 ml含有抗生素的完全PBS(含钙、镁离子的磷酸缓冲液)、1 ml三氯甲烷加入50 ml耐三氯甲烷的离心管中。②使用机械振荡器剧烈振荡20分钟,制成粪便悬液。③使用低温挎篮式离心机(bucket centrifuger),4 ℃条件下,1500 g离心力,水平离心20分钟。离心后,包含有脂溶性毒素以及有包膜微生物的三氯甲烷位于底层,EV则位于上层的PBS中。④在生物安全柜中将含有EV的上清转移至无菌的外螺旋冻存管中,以备后续检测。


肛拭子的处理可参考粪便。


(2)咽拭子标本:咽拭子要在标本运输(保存)液中充分搅动,洗下拭子上黏附的病毒及含有病毒的细胞等。然后,在4 ℃条件下,10000 r/min离心20分钟,上清用于后续病原学检测。病毒分离培养过程中,如果接种细胞后发现有细菌污染,则应使用0.45 μm无菌滤器对原始标本进行过滤以去除细菌。其他呼吸道标本处理可参考咽拭子。


(3)其他标本:脑脊液、疱疹液、心包液标本4 ℃条件下离心去除杂质和细菌后,可直接用于后续检测。结膜拭子的处理可参考咽拭子。

注意事项

(1)用于采集的咽拭子标本必须置于适当的病毒保存液中,以防病毒干燥和灭活。
(2)用于核酸检测和病毒分离的标本,应在患者发病后尽早采集,尽快检测;不能立即检测的标本应冷冻保存。
(3)对用于血清学诊断的急性期血清应该在患者发病后尽早采集,恢复期血清则应在患者发病2周后采集。
(4)临床标本在运输和贮存过程中要避免反复冻融,如果不能确保-20 ℃的条件,应该在0~8 ℃运输和保存。
(5)标本运输时要附有必要的信息,如标本编号、患者发病日期和标本采集日期。


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