α-标记核苷酸进行热循环测序反应
材料与仪器DNADNA测序缓冲液 dATP DNA聚合酶热心换反应装置 离心机步骤1. 对应于毎个待测模板,分别以A、G、C、T 标记好4个微量离心管。2.
材料与仪器
DNA
DNA测序缓冲液 dATP DNA聚合酶
热心换反应装置 离心机
DNA测序缓冲液 dATP DNA聚合酶
热心换反应装置 离心机
步骤
1. 对应于毎个待测模板,分别以A、G、C、T 标记好4个微量离心管。
2. 分别往标好A、G、C、T 的管子中,加A、G、C、T 测序混合液各3 μl。
2. 分别往标好A、G、C、T 的管子中,加A、G、C、T 测序混合液各3 μl。
3. 对于单链模板:在0.5 ml 微量离心管中混匀下列试剂
(1)0.04 pmol 单链DNA模板
(2)0.6 pmol 引物
(3)1.5 μl 10×VentR(exo-)测序缓冲液
(4)1 μl 3%Triton X-100
(5)加水至12 μl
(6)用吸管上下抽吸轻轻混匀溶液。
4. 对于双链DNA模板: 在0.5 ml 微量离心管中混匀下列试剂
(1)0.1 pmol 双链DNA模板
(2)1.2 pmol 引物
(3)1.5 μl 10×VentR(exo-)测序缓冲液
(4)1 μl 3%Triton X-100
(5)加水至12 μl
(6)通过用吸管上下抽吸,使溶液混匀。
5. 毎个模板/引物混合物加1~2 μl 10 mCi/ml[α-35S]dNATP、[α-32P]dNATP或[α-32P]dNATP,用吸管轻轻上下抽吸混合溶液。
6. 经步骤5操作后的管子,加入1 μl 2 000 U/ml 的VentR(exo-)DNA聚合酶。
(1)0.04 pmol 单链DNA模板
(2)0.6 pmol 引物
(3)1.5 μl 10×VentR(exo-)测序缓冲液
(4)1 μl 3%Triton X-100
(5)加水至12 μl
(6)用吸管上下抽吸轻轻混匀溶液。
4. 对于双链DNA模板: 在0.5 ml 微量离心管中混匀下列试剂
(1)0.1 pmol 双链DNA模板
(2)1.2 pmol 引物
(3)1.5 μl 10×VentR(exo-)测序缓冲液
(4)1 μl 3%Triton X-100
(5)加水至12 μl
(6)通过用吸管上下抽吸,使溶液混匀。
5. 毎个模板/引物混合物加1~2 μl 10 mCi/ml[α-35S]dNATP、[α-32P]dNATP或[α-32P]dNATP,用吸管轻轻上下抽吸混合溶液。
6. 经步骤5操作后的管子,加入1 μl 2 000 U/ml 的VentR(exo-)DNA聚合酶。
7. 立即往步骤2的含VentR(exo-)测序混合物A的管子中加入3.2 μl 步骤5操作后所得的混合物。
8. 分别重复此过程于C、G、T管,每次均换吸头,反应混合物,置于冰上。
9. 往每个反应混合物上滴入1滴无菌矿物油。
10. 在热循环反应装置中设定如下反应条件:20循环:20 s,90℃;20 s,55℃;20 s,72℃反应管放入热循环仪中,启动程序。
11. 在矿物油层下加入4 μl TCS终止/加样染料。
8. 分别重复此过程于C、G、T管,每次均换吸头,反应混合物,置于冰上。
9. 往每个反应混合物上滴入1滴无菌矿物油。
10. 在热循环反应装置中设定如下反应条件:20循环:20 s,90℃;20 s,55℃;20 s,72℃反应管放入热循环仪中,启动程序。
11. 在矿物油层下加入4 μl TCS终止/加样染料。
12. 样品在85℃温育3 min。
13. 将吸管头插入覆盖矿物油层下面的反应物中,取2 μl 加样于测序胶进行电泳,并读出序列。
13. 将吸管头插入覆盖矿物油层下面的反应物中,取2 μl 加样于测序胶进行电泳,并读出序列。