RNA 的提取
RNA 提取物的完整性是进行电泳的主要目的之一。在有EB 存在时,完整未降解的RNA制品电泳图谱应可清晰看到18S rRNA、28S rRNA 两条带,也应当能看到一条由tRNA、5.8SrRNA 和5S rRNA 组成的、较模糊迁移较快的条带,且28S rRNA 条带亮度应为18S rRNA的1.5-2 倍。
1、试剂耗材的准备:
(1) 试剂:
A. RNase-Free 水:配0.01 % (v/v)的Diethylpyr℃arbonate(DEPC)溶液,室温保持过夜,次日高压灭菌后,- 20 ℃ 保存。
B. 氯仿 (Chloroform),异丙醇(Isopropyl alcohol),分子生物学级别C. 75% 乙醇 (用 DEPC-treated 水配制)
(2) RNase 去除的耗材:用0.01% (v/v) DEPC 溶液完全浸泡过夜,高压灭菌后烘干。
2、实验步骤:
(1) 准备分离RNA 的细胞:
I. 悬浮细胞:
收集细胞,离心200 g,5 min。吸出培养液。每10 6 个细胞加入1 mL Trizol 裂解液,反复吹吸3 - 5 次,室温下静置10 min 后转移至干净的离心管中。
II. 贴壁细胞:
吸出培养液,每10 cm 2 生长面积的细胞加入1 mL Trizol 裂解液,反复吹吸3 - 5次,室温下静置10 min 后转移至干净的离心管中。
(2) 加入0.2 mL 氯仿(/ mL Trizol),振荡15 sec 混匀后静置2 min。
(3) 在4 ℃,12,000 g 离心15 min,混合液分成三层。
(以下所有步骤用到耗材均需用DEPC 处理并高压灭菌。)
(4) 小心吸取最上层的无色水层于干净的离心管中。加入0.5 mL 异丙醇(/ mL Trizol),室温下静置10 min。
(5) 在4 ℃,12,000 g 离心10 min,弃上清,加入1 mL 75% 乙醇(/ mL Trizol),振荡混匀。
(6) 在4 ℃,7,500 g 离心5 min,弃上清。室温下完全干燥5 - 10 min。
(7) 加入RNase‐Free 水溶解RNA 沉淀,分装后在80 ℃ 保存