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RNA实验

填补Qiagen空白的植物RNA提取试剂盒(包括多糖多酚困难样品)

2024-10-30 RNA实验 加入收藏
填补Qiagen空白、不用DNA酶消化的植物RNA提取试剂盒 一般公司多糖多酚植物RNA提取试剂盒失败原因和解决方案 很多植物RNA的样品由于含有大量的多糖、多

填补Qiagen空白、不用DNA酶消化的植物RNA提取试剂盒 一般公司多糖多酚植物RNA提取试剂盒失败原因和解决方案 很多植物RNA的样品由于含有大量的多糖、多酚、代谢产物、色素等成分,造成RNA提取过程中氧化、褐化、降解、由于植物品种的多样性造成情况更加复杂。

手工的CTAB类的方法提取因为时间太长,太繁琐,手工方法不在讨论之列。一直以来没有一款好的试剂盒包括qiagen、promega等进口试剂盒也无法满足科研工作者对植物RNA提取的要求。 下面我们来分析一下植物RNA为什么不能提取成功的原因: 市面上最常见的RNA提取试剂盒无非是两种:第一种:TRIzol改良类方法(包括溶液型的和离心柱型的)、第二种:直接裂解过柱子的方法(离心柱) 第一种试剂盒失败的原因1:RNA市面上面最流行的方法就是TRIzol,或者TRIzol改良,或者TRIzol加离心柱一类的改良方法。TRIzol也就是异硫*酸胍/苯酚/氯仿原理一步法的方法最适合的对象是动物源性的组织细胞,针对普通多糖多酚低的植物性的材料,TRIzol类原理产品也可以提取。

但是多糖、多酚、次级代谢产物丰富的情况下,TRIzol类方法无法防止多糖多酚对于RNA/DNA分相的干扰,要么残留大量DNA,要么残留大量多糖、多酚或者次级代谢产物,氧化破坏RNA,或者残留这些多糖多酚,色素代谢产物等抑制下游的反转录等反应。

限于技术水平的限制,市面上绝大多数的国产厂家是使用TRIzol的方法进行改良,无论是不是加了离心柱。但是实践证明,改良不能从根本上解决问题。判断是否试剂盒使用这种改良的方法非常简单:是否裂解液含有苯酚的味道和使用氯仿,如果使用到了氯仿就是TRIzol方法的改良。 第二种试剂盒失败的原因:直接裂解过柱子的方法是目前最先进的方法,但是也是技术含量最高的方法。这个方法采用裂解液(不含苯酚,氯仿)直接裂解,RNA/DNA同时过柱子,然后在柱子上面直接分离RNA/DNA,所以,这种方法的优点第一在于,避免了使用trizol在多糖多酚下不能成功分离RNA/DNA的弊端、第二在于,不使用有毒的苯酚氯仿。

但是正是因为其技术先进,所以难度很高,国内厂家包括进口公司有两个技术难点一直没有突破。第一,裂解液的成分必须针对去除多糖多酚进行研发添加去多糖多酚,代谢产物成分。

否则会同样碰到多糖多酚干扰提取的问题。第二、和TRIzol原理不同,直接过柱法DNA/RNA同时加到吸附柱上去。如何去除DNA是第一个难点。否则会残留大量DNA。两个技术难点的没有掌握导致了国内公司包括的第二种试剂盒失败。

国外公司因为没有掌握第一难点,裂解液里面没有去除多糖多酚成分,所以包括Qiagen的RNeasy plant mini kit盒子也常常不能成功提取较复杂植物RNA样品如黑加仑、冬青等植物样品。 北京艾德莱生物的研发人员经过3年的不断研发改良,针对多糖多酚植物的特点,和这两种试剂盒失败的原因,开发出了世界领先水平的RN09 EASYspin植物RNA快速提取试剂盒。

第一:采用直接过柱子方法,彻底抛弃了TRIzol苯酚,氯仿原理方法,使用无毒原料,并且添加了有自主知识产权的去除多糖多酚成分解决了多糖多酚和代谢产物对于RNA的破坏和干扰分离。

第二:突破了直接过柱子的方法DNA去除的技术难点,解决了DNA残留过多问题。经过实践过程中,几十种国内外试剂盒包括Qiagen的RNeasy mini kit 提取失败的例子,包括棉花苹果等试剂盒不易提取的样品,使用北京艾德莱生物的EASYspin植物RNA提取试剂盒,20分钟可以轻松提取,不需要液氮,无苯酚氯仿。高质量的RNA可以成功完成下游反应试验。

第三:实践过程中我们发现,部分复杂植物或者DNA含量特别丰富的植物样品使用Qiagen的RNeasy plant mini kit 会有明显残留。

尝试北京艾德莱的RN09 EASYspin植物RNA快速提取试剂盒也一样有明显残留。对此问题Qiagen并没有提供优秀的解决方案。

Qiagen只是建议使用传统的DNA酶消化的方法来解决,但是众所周知DNA酶消化的方法非常繁琐,费时间,消化后要回收,效果不好,还常常降解RNA,让人望而生畏,而且成本高昂,单单Qiagen的配套DNA酶柱上消化试剂盒就要1100元/50次,如果还要使用RNA清洁纯化回收DNA酶消化后的盒子就更昂贵了。

近年来北京艾德莱又投入大量研发人力物力,终于独家并且首家推出RN38 EASYspin plus 植物RNA提取试剂盒解决了DNA残留问题,该试剂盒使用基因组DNA清除柱子,配合独家研发的溶液,不需要DNA酶消化,操作简单仅需增加10秒钟清除基因组DNA残留的步骤,不用苯酚,氯仿,30分钟完成全部试验过程。

我们测试的几种植物样品中均已经获得成功,使用Qiagen的RNeasy plant mini kit 和我们RN09 EASYspin 植物RNA提取试剂盒有残留DNA的样品种类使用这款RN38 EASYspin plus 植物RNA提取试剂盒后,均无DNA残留。 部分成功样品:

棉花、海棠、黑加仑、烟草、拟南芥、虎杖、大豆、草莓、冬青、月季、蔷薇、沙棘、冬枣、芦荟、仙人掌、报春花、水稻、玉米、唐菖蒲、樱桃、白玉兰、毛白杨、樱花、葡萄、百合花、紫菜、绿藻、香蕉、水仙花、青花菜、地被菊、苹果、梅花、番茄、石斛、毛桃、苎麻等等,其中qiagen无法提取的黑加仑、promega无法提取的海棠等、均可用该产品成功提取。 推荐:北京艾德莱生物的RN09 EASYspin 植物RNA提取试剂盒为独家产品,世界领先水平,不使用苯酚,氯仿有毒性物质,采用离心柱型操作,添加有自主创新的多糖多酚去除成分,是多糖多酚样品的特效产品,不需要液氮,20分钟内得到高质量RNA。

成功提取Promega无法提取的海棠叶片、Qiagen无法提取的黑加仑等样品。是国产试剂赶超世界先进水平的一个典型例子。

同时北京艾德莱推出的RN38 EASYspin Plus植物RNA提取试剂盒进一步解决了Qiagen的RNeasy plant mini kit 部分植物样品残留大量DNA污染的问题,采用了独创的方法10秒钟解决残留问题,是艾德莱生物核酸分离技术遥遥领先的又一个里程碑,处于世界领先水平。

使用本试剂盒已经有大量文章发表,请联系我们索取发表的文章和包括北京林业大学,北京农学院,中国农业大学,农林科学院果树研究所,林业所,中国农科院,药用植物研究所等大学和研究院所大量使用案例。


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