活体RNAi关键点
在活体RNAi关键点:类似药物属性的引入,如稳定性、细胞内的传送、组织的生物可溶性进入合成的siRNA. 授予siRNA类似药物的属性 化学稳定性的胆固醇共聚的siRNA 显著的改善了其在体内和体外的药物属性。 化学稳定性增强的方法:对正义和反义链进行部分的phosporothioate backbone和 2’-O-methyl sugar 修饰,增加其在血清中和组织匀浆中对核酸内切酶和外切酶的抗性。 在反义链的3’ 端引入两个2’-O-methyl核苷酸。 增强其药物属性的方法:在正义链3’ 端通过一个pyrrolidine linker与胆固醇相连接,由于在3’ 端的连接并不改变其siRNA的活性,而且使其能够与HAS特异性的结合(human serum albumin)并且增强了其在血清中的稳定性。 核酸的生物分布:通过对siRNA的RPA分析来确定。 siRNA进入体内的方式:通过尾静脉注射 生物效应的确定: 1. 确定基因是否表达?在何种组织中特异性表达? 2. 试用RT-PCR和Western blot或者免疫组化来确定 siRNA干扰基因表达应该考虑的一些效应: 1.是否是特异性的,而非off-target效应、干扰素效应造成的。 2.siRNA特异性可以用不同的siRNA针对基因不同区域 3.设置阳性对照组,可以设置多个阳性对照组,并且通过GAPDH进行normalization处理 4.设置mismatch对照组 确认siRNA在体内的作用机制 通过5’ RACE来确认特异的mRNA断裂产物,已经在植物和小鼠胚胎中采用方法确定了miRNA指导的mRNA的断裂,此种方法是用来确认是RNAi机制的作用引起目的基因的抑制。 总的来看siRNA干扰都有相应的剂量效应。