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PCR技术

内切酶PCR反应中的活性

2024-11-13 PCR技术 加入收藏
酶切反应条件如下:在20 µl PCR产物混合体系中加入5U的内切酶,按相应的反应温度温育1小时。通常20 µl PCR产物体系中含有1 µg底物DNA,1单位

酶切反应条件如下:在20 µl PCR产物混合体系中加入5U的内切酶,按相应的反应温度温育1小时。通常20 µl PCR产物体系中含有1 µg底物DNA,1单位的Vent DNA聚合酶,1× ThermoPol Buffer [10 mM KCl, 20 mM Tris-HCl (PH 8.8@25°C),10 mM (NH4 )2 SO4 , 2 mM MgSO4和0.1% Triton X-100],以及终浓度为200 µM的dNTPs。表中标记有*的内切酶在酶切反应前需加入NaCl(终浓度为100 mM)或相应的10× NEBuffer(1×终浓度)。

注意:在非最佳条件下进行酶切反应容易出现星号活性。要避免星号活性或希望取得更好的酶切效果,则需用乙醇沉淀纯化DNA,再将其溶解于相应的酶切缓冲液。此外,如果使用不纯的DNA聚合酶,会因其中混有其它核酸酶而影响整个反应结果。

+++表示完全切割;++表示约50%被完全切割;+表示约25%被完全切割。

 

在反应物中的活性
Aat II + + + 
Acc I 
Acc65 I + + 
Aci I + + + 
Acl I + + 
Afl II + + + 
Afl III + + 
Age I + + + 
Ahd I + + 
Alu I + + + 
Alw I + + 
AlwN I + + 
Apa I + ++ 
ApaL I + + + 
Apo I + + 
Asc I + + + 
Ase I 
Ava I + + + 
Ava II + + 
Avr II + + + 
Bae Inone
BamH I + + +
Ban I + + + 
Ban II + + + 
Bbs I + + + 
Bbv I + + 
Bcg I + + 
BciV I+ + 
Bcl I + + + 
Bfa I none
Bgl I 
Bgl II + + + 
Blp I + + + 
Bmr I+ + +
Bpm I + + 
Bsa I 
BsaA I + + + 
BsaB I + + 
BsaH I + + + 
BsaJ I + + + 
BsaW I + + 
BseR I + + + 
Bsg I + + 
BsiE I + + 
BsiHKA I * + + 
BsiW I + + 
Bsl I+ + 
Bsm I + + + 
BsmB I + + 
BsmF I + + 
BsoB I + + + 
Bsp1286 I + + + 
BspD I + + 
BspE I * + + + 
BspH I + + 
BspM I none
Bsr I + + + 
BsrB I + + + 
BsrD I + + 
BsrF I + + 
BsrG I + + 
BssH II + + 
BssK I + + 
BssS I + + + 
BstB I + + + 
BstE I + + + 
BstN I + + 
BstU I + + 
BstX I + + + 
BstY I + + 
BstZ17 I + + 
Bsu36 I + + + 
Btg I+ + +
Bts I+ + +
Cac8 I + + + 
Cla I + + 
Dde I + + + 
Dpn I (none, requires methylated substrate) 
Dpn II + + + 
Dra I + + 
Dra III * + + + 
Drd I + + 
Eae I + + + 
Eag I 
Ear I + + + 
EcoN I + + 
EcoO109 I + + + 
EcoR I + + 
EcoR V + + + 
Fnu4H I + + + 
Fok I none
Fse I + + + 
Fsp I + + 
Hae II + + + 
Hae III + + + 
Hga I + + + 
Hha I + + 
Hinc II + + 
Hind III + + + 
Hinf I + + 
HinP1 I + + + 
Hpa I + + + 
Hpa II + + + 
Hph I + + + 
Kas I + + + 
Kpn I + + + 
Mbo I + + 
Mbo II + + + 
Mfe I + + 
Mlu I + + 
Mly I+ + +
Mnl I + + + 
Msc I + + 
Mse I + + 
Msl I + + + 
Msp I + + + 
MspA1 I + + + 
Mwo I + + 
Nae I 
Nar I + + 
Nci I + + 
Nco I + + + 
Nde I + + 
NgoM IV + + 
Nhe I + + 
Nla III + + + 


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