高质量 DNA 的纯化实验
材料与仪器乳腺瘤组织EDTA 异丙醇裂解缓冲液 细胞核裂解缓冲液 Triton 裂解缓冲液水浴锅 破璃棒步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂EDTA,100 m
材料与仪器
乳腺瘤组织
EDTA 异丙醇裂解缓冲液 细胞核裂解缓冲液 Triton 裂解缓冲液
水浴锅 破璃棒
EDTA 异丙醇裂解缓冲液 细胞核裂解缓冲液 Triton 裂解缓冲液
水浴锅 破璃棒
步骤
一、材料
1. 缓冲液、溶液和试剂
EDTA,100 mmol/L
异丙醇
裂解缓冲液
10 mmol/LTris-HCl
1mmol/LEDTA
150 mmol/LNaCl
0.5%SDS,pH10.5
NaCl,0.15mol/L 和 6mol/L
细胞核裂解缓冲液
75 mmol/LNaCl
24 mmol/LEDTA,pH8.0
蛋白酶 K 或者链霉蛋白酶,20 mg/ml。
SDS,200 g/L
蔗糖,lmol/L
Tris-HCl,2mol/L,pH9.2
Triton 裂解缓冲液
10mmol/LTris-HCl
5 mmol/L,MgCl2
1%TritonX-100
TE 缓冲液(lOmmol/LTris-HCl,lmmol/LEDTA,pH7.5)
蔗糖,pH9.2
TritonX-100
2. 专用设备
水浴,预热到 55°C
破璃棒
3. 细胞和组织
处理过的乳腺瘤组织(100 mg 组织用于激素受体分析)或者用 PBS 洗过 2 次的 5X105培养细胞。
二、方法
1. 向盛有细胞的 l0 ml 管中,加入 750ul 裂解缓冲液和 200ug 蛋白酶 K(或者链霉蛋酶);55°C 保温至少 90 min, 直到沉淀溶解。
2. 如果沉淀不容解,重复步骤 1。
3. 加入 250ul 6mol/LNaCl, 小心地摇动。
4.4°C 离心(3000r/min)15 min。小心将上清液转移到另一新管中。
5. 重复步骤 3 和 4。
6. 加入等体积的异丙醇,颠倒离心管直到看见 DNA。将 DNA 缠绕到玻璃棒上,沿管壁轻轻地将 DNA 拉出,将其转移到 300ul 的 TE 或者灭菌双蒸水中。
7. 放于 4°C,使其溶解。
从 10 ml 血液中提取 DNA
8. 加入 40 ml 预冷的(4°C)Triton 裂解缓冲液。
9.4°C 放置 30 min; 每隔几分钟将管子翻转一下。
10.4°C 离心(3000r/min)30 min,弃上清液。
11. 用 5~15 ml0.9%(0.15mol/L) 的 NaCl 洗沉淀(细胞核)。
12.2300r/min 离心 10min。
13. 弃上清液。细胞核可以保存在-20°C。
14. 加入 3 ml 细胞核裂解缓冲液,摇匀。
15. 加入 25ul 链霉蛋白酶(20 mg/ml) 和 230ul10%SDS,室温振摇过夜。
16. 加入 1ml6mol/L 的 NaCl,摇勾。
17.4°C 离心(3000r/min)15 min,小心将上清液转移到另一新管中。
18. 重复步骤 10。
19. 加入等体积的异丙醇,上下颠倒离心管直到看见 DNA。将 DNA 缠绕到玻璃棒上,沿着管壁轻轻地将 DNA 拉出,将其转移到 400ul 的 TE 或者灭菌双蒸水中。
20. 放于 4°C, 使其溶解。
1. 缓冲液、溶液和试剂
EDTA,100 mmol/L
异丙醇
裂解缓冲液
10 mmol/LTris-HCl
1mmol/LEDTA
150 mmol/LNaCl
0.5%SDS,pH10.5
NaCl,0.15mol/L 和 6mol/L
细胞核裂解缓冲液
75 mmol/LNaCl
24 mmol/LEDTA,pH8.0
蛋白酶 K 或者链霉蛋白酶,20 mg/ml。
SDS,200 g/L
蔗糖,lmol/L
Tris-HCl,2mol/L,pH9.2
Triton 裂解缓冲液
10mmol/LTris-HCl
5 mmol/L,MgCl2
1%TritonX-100
TE 缓冲液(lOmmol/LTris-HCl,lmmol/LEDTA,pH7.5)
蔗糖,pH9.2
TritonX-100
2. 专用设备
水浴,预热到 55°C
破璃棒
3. 细胞和组织
处理过的乳腺瘤组织(100 mg 组织用于激素受体分析)或者用 PBS 洗过 2 次的 5X105培养细胞。
二、方法
1. 向盛有细胞的 l0 ml 管中,加入 750ul 裂解缓冲液和 200ug 蛋白酶 K(或者链霉蛋酶);55°C 保温至少 90 min, 直到沉淀溶解。
2. 如果沉淀不容解,重复步骤 1。
3. 加入 250ul 6mol/LNaCl, 小心地摇动。
4.4°C 离心(3000r/min)15 min。小心将上清液转移到另一新管中。
5. 重复步骤 3 和 4。
6. 加入等体积的异丙醇,颠倒离心管直到看见 DNA。将 DNA 缠绕到玻璃棒上,沿管壁轻轻地将 DNA 拉出,将其转移到 300ul 的 TE 或者灭菌双蒸水中。
7. 放于 4°C,使其溶解。
从 10 ml 血液中提取 DNA
8. 加入 40 ml 预冷的(4°C)Triton 裂解缓冲液。
9.4°C 放置 30 min; 每隔几分钟将管子翻转一下。
10.4°C 离心(3000r/min)30 min,弃上清液。
11. 用 5~15 ml0.9%(0.15mol/L) 的 NaCl 洗沉淀(细胞核)。
12.2300r/min 离心 10min。
13. 弃上清液。细胞核可以保存在-20°C。
14. 加入 3 ml 细胞核裂解缓冲液,摇匀。
15. 加入 25ul 链霉蛋白酶(20 mg/ml) 和 230ul10%SDS,室温振摇过夜。
16. 加入 1ml6mol/L 的 NaCl,摇勾。
17.4°C 离心(3000r/min)15 min,小心将上清液转移到另一新管中。
18. 重复步骤 10。
19. 加入等体积的异丙醇,上下颠倒离心管直到看见 DNA。将 DNA 缠绕到玻璃棒上,沿着管壁轻轻地将 DNA 拉出,将其转移到 400ul 的 TE 或者灭菌双蒸水中。
20. 放于 4°C, 使其溶解。