RNA 的琼脂糖凝胶电泳实验
简介
RNA 电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。非变性电泳使用 1.0% ~ 1.4% 的凝胶,不同的 RNA 条带也能分开,但无法判断其分子量。只有在完全变性的条件下,RNA 的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。因此要测定 RNA 分子量时,一定要用变性凝胶。在需快速检测所提总 RNA 样品完整性时,配制普通的 1% 琼脂糖凝胶即可。
材料与仪器
器材:
MOPS 缓冲液电泳仪、电泳槽、电子天平、移液器、枪头、微波炉、紫外透射检测仪、封口膜
试剂:
RNA 样品溶液琼脂糖
1×TAE 电泳缓冲液
0.5 μg/mL 溴化乙锭(EB)
10× 载样缓冲液
步骤
1. 将制胶用具用 70% 乙醇冲冼一遍,晾干备用。
2. 用 1xTAE 电泳缓冲液制作琼脂糖凝胶,加 1xTAE 电泳缓冲液至液面覆盖凝胶。
① 称取 0.5 g 琼脂糖,置干净的 100 mL 锥形瓶中,加入 40 mL 蒸馏水,微波炉内加热使琼脂糖彻底溶化均匀。
② 待胶凉至 60~70 ℃,向其中加入 0.5 uL 溴化乙锭,混合均匀。
③ 灌制琼脂糖凝胶。
3. 在超净工作台上,用移液器吸取总 RNA 样品 4 uL 于封口膜上。在实验台上再加入 5 uL 1xTAE 电泳缓冲液及 1 uL 的 10× 载样缓冲液,混匀后,小心加入点样孔。
4. 打开电源开关,调节电压至 100 V,使 RNA 由负极向正极电泳,约 30 min 后将凝胶放入 EB 染液中染色 5 min,用清水稍微漂洗。在紫外透射检测仪上观察 RNA 电泳结果。
注意事项
RNA 琼脂糖凝胶电泳中务必去除 RNase 酶的污染,所有的试剂需用 DEPC 水配制,所用的器材也要用 DEPC 处理并灭菌,防止 RNA 被降解。