cDNA文库组标准流程
第一部分 Total RNA 的提取
一、 试剂配制
准备工作:
1、研钵、5ml/10ml/ 25ml移液管、100ml/250ml量筒、250ml/100ml容量瓶、药匙、 试剂瓶等玻璃制品均用锡纸包裹口部,置于烤箱内,180℃,烤6小时。
2、50ml/1.5ml离心管、枪头等塑料制品用0.1‰DEPC水浸泡过夜后,121℃ 20mins 高压灭菌。
3、电泳槽及电泳托、梳子用3%双氧水处理。
4、常用试剂及其配方:
▲DEPC水:在1000ml去离子水中加入100ul DEPC, 静置过夜后高压灭菌。
▲0.78M柠檬酸纳:PH=4~5
三水合柠檬酸纳 22.94g
加DEPC水定容至100ml,室温放置备用。
▲10%肌氨酸钠:
肌氨酸钠 10g
加DEPC水定容至100ml,室温放置备用。
▲变性裂解液:
0.78M柠檬酸钠 8.25ml
10%肌氨酸钠 12.375ml
异硫氰酸胍 118.05g
加DEPC水定容至 250ml,室温放置备用
临用前加β-巯基乙醇使其终浓度为1%(v/v)
▲2M 醋酸钠 PH=4.5
NaAc・3H2O 13.6g
加DEPC水定容至50ml,高压灭菌,室温放置备用
▲3M醋酸钠PH=5
NaAc・3H2 O 20.4g
加DEPC水定容至50ml,高压灭菌,室温放置备用
▲ 4M LiCL:
LiCL 24.164g
加DEPC水定容至100ml,高压灭菌,室温放置备用
▲0.5M EDTA PH=8.0
EDTA 18.61g
用NaOH调PH值至8.0,定容到100ml,高压灭菌,室温放置备用
▲10X MOPS (3-(N-吗啉代)丙磺酸):
MOPS 41.86g
NaAC・3H2O 4.10g
0.5MEDTA(PH 8.0) 20ml
用NaOH调PH值 6.5 , DEPC水定容到1L,室温避光放置备用。
▲1x MOPS:
10x MOPS 30ml
加DEPC水270ml,用时现配。
▲4x RNA Loading buffer:
10x MOPS 400ul
甘油(高压过) 200UL
溴酚兰 10ul
甲醛(37%) 72ul
去离子甲酰氨 310ul
EDTA(0.5M PH 8.0) 8ul
ErBr(10mg/ml in DEPCH2O) 70ul
在4℃ 可保持3个月
▲10x PBS
pH=7.4
NaCl 80g
KCl 2g
Na2HPO4 14.4g
KH2PO4 2.4g
定容至1000ml
▲变性电泳胶:
称取0.5g琼脂糖,加入47.5ml 1x MOPs,加热至琼脂糖熔化后,冷却至50℃左右,加入2.5ml甲醛,轻轻混匀后倒入电泳托上。
▲变性电泳缓冲液:
在250ml容量瓶内加入5ml甲醛,用1x MOPS定容至250ml