原位聚合酶链式反应与原位反转录聚合酶链式反应操作规程
(一)、 仪器 设备 英国Thermo Hybaid原位PCR仪。 (二)、操作流程 1、原位PCR步骤 1)预处理: (1)切片常规脱蜡; (2)0.2mol/L HCl处理10min; (3)5μg/ml蛋白酶K消化组织37℃10min; (4)Nase消化组织37℃ 30min; (5)梯度酒精脱水,室温干燥。 2)原位扩增: (1)切片滴加特异性序列引物30μLPCR扩增反应液,覆盖硅化盖玻片,石蜡油封边; (2)PCR热循环:94℃,1min;55℃,1min;72℃,1.5min,共25~30个循环,72℃延伸10min; (3)氯仿洗去盖玻片,4%多聚甲醛后固定10min,梯度酒精脱水,干燥。 3) 原位杂交: (1)加地高辛标记探针的杂交液,98℃变性10min,-20℃退火5min,42℃杂交过夜。 (2)杂交后用2×SSC洗涤10min,3次,1×SSC洗涤10min,3次; (3)缓冲液洗涤10min,3次; (4)加碱性磷酸酶标记的羊抗地高辛抗体复合物,37℃,2h; (5)缓冲液洗涤5min,3次; (6)NBT、BCIP暗处显色,镜下控制,终止显色。 (7)常规脱水:透明、封固。 2、原位RT-PCR步骤 1)预处理: (1)蛋白酶K(0.3mg/mL) 54℃消化20min,蒸馏水洗; (2)95℃加热3min,灭活残存的蛋白酶。 2)原位扩增: (1)在有RNA酶抑制剂存在的条件下,用随机六聚物进行逆转录反应; (2)用热启动法进行PCR扩增。标本加热至75℃时加上反应液,覆以盖玻片,四周用指甲油密封。然后将温度升至95℃,2min。再将热循环仪设定为95℃,45s,55℃,1min和75℃,45s,共26次循环; (3)扩增结束后,在80℃烤15min~30min。 3)原位杂交: (1)杂交前标本95℃加热3min; (2)加上杂交液,湿盒内50℃过夜;杂交液组成:25%硫酸葡聚糖,2×SSC,50%甲酰胺,0.33mg/ml变性的鲑鱼精子DNA, 每0.5mL杂交液内含生物素标记探针1ng。 (3)扩增的β-肌动蛋白和IL-6用DAKO检测 试剂 盒K600(链霉卵白素, 生物 素标记的碱性 磷酸酶 和硝基四氮唑蓝)检测。阳性反应呈紫色。